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标题: 集群设置高斯使用核数和内存出现错误。 [打印本页]

作者
Author: loovfnd 时间: 2018-4-13 14:44
标题: 集群设置高斯使用核数和内存出现错误。
在集群上使用高斯09，核数设为单片的三倍28*3时，出现内存错误。如下：
%mem=128GB
%nprocshared=84
Will use up to 84 processors via shared memory.
# M062x/6-311g* scrf=(SMD, solvent=o-Dichlorobenzene)
-----------------------------------------------------
1/38=1/1;
2/12=2,17=6,18=5,40=1/2;
3/5=4,6=6,7=1,11=2,16=1,25=1,30=1,70=32201,72=156,74=-55/1,2,3;
4//1;
5/5=2,38=5,53=156/2;
6/7=2,8=2,9=2,10=2,28=1/1;
99/5=1,9=1/99;
galloc: could not allocate memory.

而当使用
%mem=128GB
%nprocshared=28
可以正常运算。这是怎么回事？求教。

使用的是曙光lsf文件提交。

作者
Author: sobereva 时间: 2018-4-13 21:32
为什么要设84？
节点里有多少物理核心？
绝对不要超过物理核心数，linda的话另谈。

作者
Author: loovfnd 时间: 2018-4-17 15:09

sobereva 发表于 2018-4-13 21:32
为什么要设84？
节点里有多少物理核心？
绝对不要超过物理核心数，linda的话另谈。

发现是linda设置的问题，还没弄好。

作者
Author: xxzj 时间: 2021-6-28 16:53

sobereva 发表于 2018-4-13 21:32
为什么要设84？
节点里有多少物理核心？
绝对不要超过物理核心数，linda的话另谈。

老师，我在g09上面提交任务，出现了下面问题，想请问老师如何才能提交任务到cu61
Unable to run job: denied: host "cu63" is not a submit host
Exiting.
然后计算节点是cu61，高斯自动生成的sge文件如下： (, 下载次数 Times of downloads: 28)

作者
Author: abin 时间: 2021-6-28 19:13
g09 用这么多核心，
不怕很慢呀？

作者
Author: wzkchem5 时间: 2021-6-28 19:24

xxzj 发表于 2021-6-28 09:53
老师，我在g09上面提交任务，出现了下面问题，想请问老师如何才能提交任务到cu61
Unable to run job: de ...

这种问题应该问你们服务器的管理员。我们又不了解你的服务器，不知道cu63、cu61和你提交任务用的节点之间是什么关系，更不知道你们系统是怎么配置的

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