计算化学公社

标题: 关于团簇模型的问题 [打印本页]

作者
Author: yiranfengbai 时间: 2018-4-17 22:50
标题: 关于团簇模型的问题
Sob老师好，1，我想做金属氧化物AnBm(n和m不相等，且在5-15之间)团簇，主要是想找到其幻数团簇结构，但目前能查到的文献的团簇结构都比较小，不知道Sob老师有没有方法能够推荐？
2，molcius程序做团簇，首先需要用分子动力学生成轨迹文件，请问用MS可以生成吗？具体应该怎么做呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2018-4-18 03:24
1 这方面我研究不多，就不乱提意见了
2 不是必须做动力学。用genmer也可以产生初始结构，看
genmer：生成团簇初始构型的超便捷工具
http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=2369

还有其它的诸如ABCluster、CALYPSO也可以试试

作者
Author: niobium 时间: 2018-4-18 08:43
金属氧化物的团簇模型是个坑啊，模型难构建，SCF难收敛，楼主具体做的什么体系？

作者
Author: yiranfengbai 时间: 2018-4-18 09:45

sobereva 发表于 2018-4-18 03:24
1 这方面我研究不多，就不乱提意见了
2 不是必须做动力学。用genmer也可以产生初始结构，看
genmer：生成 ...

好的，我去试试，多谢sob老师。

作者
Author: yiranfengbai 时间: 2018-4-18 09:47

niobium 发表于 2018-4-18 08:43
金属氧化物的团簇模型是个坑啊，模型难构建，SCF难收敛，楼主具体做的什么体系？

目前在做Fe2O3体系，随后还想做其他的，主要问题也是模型不好建，收敛也很难，不知道你有什么好的方法吗

作者
Author: niobium 时间: 2018-4-18 10:23

yiranfengbai 发表于 2018-4-18 09:47
目前在做Fe2O3体系，随后还想做其他的，主要问题也是模型不好建，收敛也很难，不知道你有什么好的方法吗

我曾经做过氧化铝，后来放弃了。不过我的团簇建得很大，你的体系如果不大的话，可能收敛会容易些。建议可以先用纯泛函做，可能收敛好一些。

作者
Author: sobereva 时间: 2018-4-19 03:32
优化过程可以先用较宽松的SCF收敛限，比如SCF=conver=6，优化得差不多再用默认收敛限进一步优化，是对付金属团簇体系SCF不收敛的有效途径

作者
Author: yiranfengbai 时间: 2018-4-19 18:33

sobereva 发表于 2018-4-19 03:32
优化过程可以先用较宽松的SCF收敛限，比如SCF=conver=6，优化得差不多再用默认收敛限进一步优化，是对付金 ...

Sob老师，有时SCF不收敛时，我用opt=cartesian就可以正常优化，请问这样处理后的结果可信吗？能否用于后续的计算？

作者
Author: sobereva 时间: 2018-4-20 03:21

yiranfengbai 发表于 2018-4-19 18:33
Sob老师，有时SCF不收敛时，我用opt=cartesian就可以正常优化，请问这样处理后的结果可信吗？能否用于后 ...

二者之间没有直接关系，看似解决了问题只不过是巧合而已
结果是没问题的，但最好做振动分析确认无虚频

作者
Author: yiranfengbai 时间: 2018-4-20 09:12

sobereva 发表于 2018-4-20 03:21
二者之间没有直接关系，看似解决了问题只不过是巧合而已
结果是没问题的，但最好做振动分析确认无虚频

好的，谢谢sob老师。

作者
Author: liuyjhx 时间: 2019-9-6 14:54

yiranfengbai 发表于 2018-4-18 09:47
目前在做Fe2O3体系，随后还想做其他的，主要问题也是模型不好建，收敛也很难，不知道你有什么好的方法吗

请问你的Fe2O3团簇的模型是怎么建立起来的？

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