计算化学公社
标题:
xtb固定原子优化失败
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作者Author:
harrypotty18
时间:
2018-4-17 23:56
标题:
xtb固定原子优化失败
采用GNF-xtb优化一个有机分子和一个水分子的体系,我按照Grimme提供的HOWTO手册上说明,试了三种方法:1.拷贝一份xyz文件为fix文件,并在水分子的氧原子后面设定了f字符表示固定
2.在xtbrc里面设定fix 85(我固定的氧原子的序号),然后设定fixfc 0
3.组合使用两种方法
结果发现优化后水分子偏离初始设定的位置,请教大家有什么解决方案么?
作者Author:
liyuanhe211
时间:
2018-4-18 03:51
你只固定了一个原子吗?那想象起来和不固定应该是完全一样的。无非是水跑过去还是别的东西跑到水面前来的区别
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