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标题: ICSS计算导入NICS结果时闪退 [打印本页]

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drogonfly    时间: 2018-4-24 07:23
标题: ICSS计算导入NICS结果时闪退
老师您好,我在参照您的帖子http://sobereva.com/216绘制ICSS图,在导入NICS结果时,程序总是闪退。我仔细对照过您在帖子中的苯的例子,发现在您的例子中,settings.ini中NICSnptlim值必须为默认值8000,才能正确的导入NICS结果,否则还是会出现闪退的问题。
而我在计算中,延展设置为12Bohr,格点为low quality grid,NICSnptlim修改为2000。在高斯计算NICS过程中,multiwfn程序并未关闭(NICSnptlim的修改在multiwfn启动之前),因此不存在延展距离和格点不一致的问题及NICSnptlim值冲突的问题,但在导入NICS结果时还是发生闪退。这种情况只在我计算立体结构的时候出现,平面或伪平面结构计算时都未出现,但根据您在帖子中的描述,富勒烯之类的立体结构也是可以计算的,因此我不确定是什么原因导致的闪退。我将输入和结果文件一并发给您,希望您能给与解决,谢谢。

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sobereva    时间: 2018-4-24 17:27
你的每个.out文件里只有1999个原子,不正常,按照NICSnptlim=2000来读取肯定会失败
得弄清楚为什么只有1999个原子(比如是否是虚原子搞鬼?)

PS:当前体系不加极化函数,ICSS的结果定性正确性难以保证,特别是对P这样的原子,没有极化函数完全没法接受。最起码得给P加上极化。而至于给氢加弥散,则是多余的。

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drogonfly    时间: 2018-4-24 20:15
sobereva 发表于 2018-4-24 17:27
你的每个.out文件里只有1999个原子,不正常,按照NICSnptlim=2000来读取肯定会失败
得弄清楚为什么只有199 ...

感谢sob老师的回复,我去确认一下是什么原因引起的原子数的差异
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drogonfly    时间: 2018-4-27 06:01
sobereva 发表于 2018-4-24 17:27
你的每个.out文件里只有1999个原子,不正常,按照NICSnptlim=2000来读取肯定会失败
得弄清楚为什么只有199 ...

Sob老师您好,根据您的回复我又重新提交了一遍任务,并将每个结果文件都检查了一遍;除了最后一个,其他的.out文件中均包含2000个原子,但这次仍然在导入NICS结果的那一步闪退,而且从闪退前显示的导入列表看,是在NICS0075前后发生的闪退,我检查了几遍还是没发现问题。这次计算的延展设置为12Bohr,格点为自定义0.5,0.5,0.5,NICSnptlim为2000。我把所有的输入和输出文件都发给您,麻烦您再给看一下是什么问题,十分感谢。
文件大小超出附件的上限,我上传到百度网盘里了,地址在这里:
https://pan.baidu.com/s/1H0xofoSzt_EaJdDMSZntxw

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sobereva    时间: 2018-4-27 18:48
drogonfly 发表于 2018-4-27 06:01
Sob老师您好,根据您的回复我又重新提交了一遍任务,并将每个结果文件都检查了一遍;除了最后一个,其他 ...

你的很多任务都失败了,比如NICS0081。必须正常结束才行
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pigfool    时间: 2019-6-18 15:29
drogonfly 发表于 2018-4-27 06:01
Sob老师您好,根据您的回复我又重新提交了一遍任务,并将每个结果文件都检查了一遍;除了最后一个,其他 ...

楼主,你好!请问是如何解决原子数不符的问题的?谢谢!




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