计算化学公社

标题: gaussian 计算freq 计算时间短并且未报错直接退出问题求助 [打印本页]

作者
Author: ipoy 时间: 2018-4-26 23:36
标题: gaussian 计算freq 计算时间短并且未报错直接退出问题求助
本帖最后由 ipoy 于 2018-4-27 10:13 编辑

请各位大神帮忙看看小弟的计算。
计算一个含有C, H, O, Na, Li, Si 的一个94原子组成的小分子。想要计算NBO轨道。

我用opt用这个方法和基组计算了该分子，在我们的服务器上计算了4天计算出来。
但是加入freq,没算几分钟就停止了，没有提示是什么原因终止的。

我已经用该方法计算了另一个分子，不含有Na原子的分子，可以计算出来，NBO轨道也能画出来。

*****************************************************************************
输入文件：
%Nproc=16
%mem=64GB
#p freq M062x/6-31+g(d) nosymm
pop=(full,nboread)

NAME

坐标

$nbo
bndidx
plot file=NAME
$end
******************************************************************************
输出文件：（节选）

**** Warning!!: The largest alpha MO coefficient is  0.11540839D+03

Leave Link  801 at Thu Apr 26 18:57:15 2018, MaxMem= 8589934592 cpu:    0.4
(Enter /home/315/g09/l1101.exe)
Using compressed storage, NAtomX= 94.
Will process  95 centers per pass.
Leave Link 1101 at Thu Apr 26 18:57:19 2018, MaxMem= 8589934592 cpu:    66.1
(Enter /home/315/g09/l1102.exe)
Symmetrizing basis deriv contribution to polar:
IMax=3 JMax=2 DiffMx= 0.00D+00
Leave Link 1102 at Thu Apr 26 18:57:20 2018, MaxMem= 8589934592 cpu:    3.5
(Enter /home/315/g09/l1110.exe)
Forming Gx(P) for the SCF density, NAtomX= 94.
Integral derivatives from FoFDir/FoFCou, PRISM(SPDF).
Do as many integral derivatives as possible in FoFDir.
G2DrvN: MDV= 8589933736.
G2DrvN: will do 95 centers at a time, making 1 passes doing MaxLOS=2.
Calling FoFCou, ICntrl=  3107 FMM=T I1Cent= 0 AccDes= 0.00D+00.
FoFCou: FMM=T IPFlag=          0 FMFlag=    100000 FMFlg1=       2001
      NFxFlg=          0 DoJE=F BraDBF=F KetDBF=F FulRan=T
      Omega=  0.000000  0.000000  1.000000  0.000000  0.000000 ICntrl= 3107 IOpCl=  0
      NMat0= 1 NMatS0= 1 NMatT0= 0 NMatD0= 1 NMtDS0= 0 NMtDT0= 0
      I1Cent=          0 NGrid=          0.
Symmetry not used in FoFCou.
FMM levels:  10  Number of levels for PrismC: 9
************************************************************************************
标题不对，或者板块错误，请版主及时纠正。
小弟万分感谢！！！

作者
Author: sobereva 时间: 2018-4-27 00:07
表述太混乱。freq是freq、NBO是NBO，无直接关系的问题不要掺和在一起提
输出的信息表明明显还没做到NBO的步骤，还在做freq
大体系freq是非常耗时间的

作者
Author: ipoy 时间: 2018-4-27 08:46
sobereva大神，是这样，我先单独的做了一个opt，算了好久才算出来。我把算出来的结构使用freq来算，不到一个小时就退出来了，而且还没有报错。想问一下是什么原因。

作者
Author: gauss98 时间: 2018-4-27 08:57

ipoy 发表于 2018-4-27 08:46
sobereva大神，是这样，我先单独的做了一个opt，算了好久才算出来。我把算出来的结构使用freq来算，不到一 ...

算freq时有内存问题

设置内存不要超过物理内存的一半

作者
Author: ipoy 时间: 2018-4-27 08:58

gauss98 发表于 2018-4-27 08:57
算freq时有内存问题

设置内存不要超过物理内存的一半

感谢，我试一下.......

作者
Author: ipoy 时间: 2018-4-27 10:14
本帖最后由 ipoy 于 2018-4-27 10:26 编辑

gauss98 发表于 2018-4-27 08:57
算freq时有内存问题

设置内存不要超过物理内存的一半

经过我把%mem=64GB改成32之后，这个问题还是没有得到解决。能不能我帮在想想想是什么原因。

我想问一下，chk文件的作用是什么？我用opt计算时，没有chk文件就能计算出来。但是我觉得用freq计算没chk文件不行吧？我又加上chk文件试了一试，看看效果如何。
@sobereva

作者
Author: sobereva 时间: 2018-4-27 11:49

ipoy 发表于 2018-4-27 10:14
经过我把%mem=64GB改成32之后，这个问题还是没有得到解决。能不能我帮在想想想是什么原因。

这和你设不设%chk完全无关
就算你不写%chk，实际上运算过程中chk文件还是会产生在临时文件目录里
如果算到那里莫名其妙就中断了，换个Gaussian版本再试

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