计算化学公社

标题: Grimme的有机金属反应benchmark(MOR41测试集) [打印本页]

作者
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sobereva    时间: 2018-4-30 01:00
标题: Grimme的有机金属反应benchmark(MOR41测试集)
Grimme新发表了含有41个闭壳层有机金属反应的测试集MOR41的文章Comprehensive Thermochemical Benchmark Set of Realistic Closed-Shell Metal Organic Reactions
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jctc.7b01183

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测试以DLPNO-CCSD(T)/CBS作为基准。从测试结果上看,算这类问题,PWPB95-D3是最理想的双杂化泛函,而DSD-PBEP86-D3(BJ)再次令人大跌眼镜。和我在《简谈量子化学计算中DFT泛函的选择》(http://sobereva.com/272)中提倡使用PWPB95-D3而慎用DSD-PBEP86-D3(BJ)的论调一致。

流行的杂化泛函里,PBE0-D3(BJ)表现最为抢眼,值得优先考虑。M06-2X不适合用于过渡金属体系,而M06则更好,这点是众所周知的,本文测试再次印证了这一点。
纯泛函里,SCAN-D3(BJ)表现最好,但鉴于目前支持还不广泛,可暂时用TPSS-D3(BJ)。常用的BP86-D3(BJ)和M06L-D3表现中规中矩,至少没有大跌眼镜。
MP2果然垃圾得很,考虑SCS也救不活。
本文数据体现不久前Grimme提出的廉价的B97-3c的普适性不错,用于有机金属反应也很划算。
本文考察的都是闭壳层体系,对于开壳层情况,结论可能会有所不同。
作者
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liyuanhe211    时间: 2018-4-30 06:08
之前用实验上的几个比较容易对照的量做个小的Benchmark比对,在溶剂化依赖 SMD, M05-2X/6-31G(d) 的前提下确实PWPB95-D3好过DSD-PBEP86(QZ级别),M06-D3/TZ或QZ给出过定性十分错误的结果,还不如优化的时候PBE0/(TZ for M, DZ for CHON) 的能量靠谱。直观感觉上比较一致。

不过样例不够多,不排除有偶然性;另外虽然选择了电荷没有明显变化的过程,但也不排除误差出在溶剂化上的问题。
作者
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sobereva    时间: 2018-4-30 12:10
文中没有测试MN15、MN15L,以及在一些过渡金属相关测试中表现很好的B97-1,是个遗憾
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rayinyin    时间: 2018-5-2 09:10
那是不是说计算向Pd催化的反应机理,更应该用m06而不是m06-2x去做单点能校正?

作者
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sobereva    时间: 2018-5-2 14:38
rayinyin 发表于 2018-5-2 09:10
那是不是说计算向Pd催化的反应机理,更应该用m06而不是m06-2x去做单点能校正?

M06-2X肯定不适用
M06也未必好
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Accelerator    时间: 2018-5-3 10:13
PWPB95-D3在G09里要如何输入呢
作者
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sobereva    时间: 2018-5-3 16:07
Accelerator 发表于 2018-5-3 10:13
PWPB95-D3在G09里要如何输入呢

没办法




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