计算化学公社

标题: 关于Cl离子在水溶液中的吉布斯自由能 [打印本页]

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Author: yan505256466 时间: 2018-5-11 17:32
标题: 关于Cl离子在水溶液中的吉布斯自由能
老师，您好，我在计算反应机理时涉及到Cl离子，反应中没有加添加剂，为了计算反应能垒，想知道怎样得到Cl离子在水中的吉布斯自由能，非常感谢。

作者
Author: sobereva 时间: 2018-5-12 04:00
计算Cl-离子的溶解自由能（应该可以查到，自己算不容易算准），然后加到Cl-的真空下的吉布斯自由能上，即是Cl-在溶液下的自由能

作者
Author: yan505256466 时间: 2018-5-12 23:50

sobereva 发表于 2018-5-12 04:00
计算Cl-离子的溶解自由能（应该可以查到，自己算不容易算准），然后加到Cl-的真空下的吉布斯自由能上，即是 ...

非常感谢老师的回答，我再查一下Cl-的溶解自由能。另外，老师说的真空下的吉布斯自由能是可以直接在气相条件下计算得到还是也需要查到实验值呢。非常感谢。

作者
Author: sobereva 时间: 2018-5-13 05:36

yan505256466 发表于 2018-5-12 23:50
非常感谢老师的回答，我再查一下Cl-的溶解自由能。另外，老师说的真空下的吉布斯自由能是可以直接在气相 ...

直接理论计算。用的计算级别应当和你计算其它物质时相同，这样才有可比性

作者
Author: yan505256466 时间: 2018-5-13 12:24

sobereva 发表于 2018-5-13 05:36
直接理论计算。用的计算级别应当和你计算其它物质时相同，这样才有可比性

好的，我知道了，谢谢老师的耐心解答。

作者
Author: yan505256466 时间: 2018-5-18 19:17

sobereva 发表于 2018-5-13 05:36
直接理论计算。用的计算级别应当和你计算其它物质时相同，这样才有可比性

老师，您好，离子在真空下的吉布斯自由能，应该读这个值吗？Sum of electronic and thermal Free Energies，非常感谢。

作者
Author: sobereva 时间: 2018-5-18 23:20

yan505256466 发表于 2018-5-18 19:17
老师，您好，离子在真空下的吉布斯自由能，应该读这个值吗？Sum of electronic and thermal Free Energie ...

这是最糙的计算方式

作者
Author: yan505256466 时间: 2018-5-19 13:26

sobereva 发表于 2018-5-18 23:20
这是最糙的计算方式

老师，您好，我想请问一下应该通过哪种方式计算离子在真空下的吉布斯自由能比较合适一点呢，麻烦你了，谢谢。

作者
Author: sobereva 时间: 2018-5-19 22:28

yan505256466 发表于 2018-5-19 13:26
老师，您好，我想请问一下应该通过哪种方式计算离子在真空下的吉布斯自由能比较合适一点呢，麻烦你了，谢 ...

此文明确说了自由能该怎么算
谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算
http://sobereva.com/327

作者
Author: yan505256466 时间: 2018-5-20 07:34

sobereva 发表于 2018-5-19 22:28
此文明确说了自由能该怎么算
谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算
http://sobereva.com/32 ...

感谢老师的回答，我学习了一下，比如我想用帖子里的第二种方法。先在低精度下计算吉布斯热矫正量，之后再在高精度下计算单点能。比如计算吉布斯热矫正量用M06/6-31++g**（跟其它结构一致），那高精度下计算单点换别的计算级别，就跟别的结构不一致了？另外，我想问一下老师，高斯优化时是直接用单个的Cl-来计算的吗？非常感谢老师的耐心指导。

作者
Author: sobereva 时间: 2018-5-20 22:33

yan505256466 发表于 2018-5-20 07:34
感谢老师的回答，我学习了一下，比如我想用帖子里的第二种方法。先在低精度下计算吉布斯热矫正量，之后再 ...

“别的结构”意义不明
单个Cl-显然没法优化

作者
Author: yan505256466 时间: 2018-5-21 07:46

sobereva 发表于 2018-5-20 22:33
“别的结构”意义不明
单个Cl-显然没法优化

老师，您好，别的结构就是反应中其它构型的优化（均采用的m06泛函），如果Cl-低精度是在m06水平优化的话，那高精度换一个泛函之后就跟体系中其它结构不一致了。另外，我应该考虑Cl-跟溶剂分子（H2O）结合来优化吗？如果可以这样，那几个H2O分子合适呢。还是别的方式优化。麻烦老师了，谢谢。

作者
Author: sobereva 时间: 2018-5-23 17:50

yan505256466 发表于 2018-5-21 07:46
老师，您好，别的结构就是反应中其它构型的优化（均采用的m06泛函），如果Cl-低精度是在m06水平优化的话 ...

不同体系之间如果对比，优化级别必须相同，单点级别必须相同，但绝对不需要也不建议单点和优化级别相同

一般不用考虑H2O

作者
Author: yan505256466 时间: 2018-5-28 12:25

sobereva 发表于 2018-5-23 17:50
不同体系之间如果对比，优化级别必须相同，单点级别必须相同，但绝对不需要也不建议单点和优化级别相同
...

好的，明白了，感谢老师的耐心解答。

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