计算化学公社
标题:
如何设置表面活性剂中各原子的电荷?
[打印本页]
作者Author:
truemantwo
时间:
2015-4-23 19:49
标题:
如何设置表面活性剂中各原子的电荷?
小弟想模拟表面活性剂(SDBS)。一般来说,SDBS的有机化合物部分(C、H、O),其总电荷数应该是-1;离子部分(Na)的电荷数应该是+1。
若用PCFF力场,发现它设置的电荷不正确:SDBS中有机化合物部分的总电荷是0,Na离子的电荷也设成了0。
如果是用COMPASS力场,发现体系的电荷设置基本合理:SDBS中有机化合物部分的总电荷是-1,Na离子的电荷设成了+1。
由于种种原因,我的计算不能采用COMPASS力场。
小弟想了一个办法:体系的电荷用COMPASS力场产生,但是其它部分用PCFF力场计算。不知是否合理?请各位指教。
感激不尽!
作者Author:
sobereva
时间:
2015-4-27 14:31
你看看对于其它体系,PCFF计算时分配的原子电荷和COMPASS的有多大差异。如果大体相同,从COMPASS借过来电荷估计问题不大。
作者Author:
truemantwo
时间:
2015-4-27 14:58
sobereva 发表于 2015-4-27 14:31
你看看对于其它体系,PCFF计算时分配的原子电荷和COMPASS的有多大差异。如果大体相同,从COMPASS借过来电荷 ...
谢谢sobereva大侠!
作者Author:
AbaFlu
时间:
2019-3-27 23:19
验证了一下,似乎是可以的
作者Author:
tjyjy
时间:
2023-1-26 20:59
你好,请问你在优化SDBS的时候,是如何选择charges的?(是参考一些论文的设置吗?)
欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)
Powered by Discuz! X3.3