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标题: Gaussian优化复合物疑问 [打印本页]

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lijiayisjtu    时间: 2018-5-14 09:26
标题: Gaussian优化复合物疑问
用高斯有段时间,一直有两个计算上的疑问,想询问大家。
1:如何确定能量最低的复合物?比如A和B组成的AB反应复合物,改变结构后高斯都能收敛但能量有差异,比如优化TS结构,此TS为OH与Cl断键,与S成键(已跑IRC验证),但稍微改变OH,Cl或硫代磷酸酯基团的位置,优化后的TS结构,能量均有不同。
2:对于rea(直接优化反应物,做opt)和IRC-rea(取IRC曲线一端的反应物结构,再做opt),计算能垒时,是否为TS的吉布斯自由能 减去IRC-rea的吉布斯自由能?

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李海波    时间: 2019-10-15 14:01
请问一下,楼主的反应复合物和生成复合物是用IRC两端的优化出来的吗,我现在也在想怎么算能垒的问题,想问一下楼主怎么解决的
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lijiayisjtu    时间: 2019-10-15 19:36
李海波 发表于 2019-10-15 14:01
请问一下,楼主的反应复合物和生成复合物是用IRC两端的优化出来的吗,我现在也在想怎么算能垒的问题,想问 ...

势能面是 很复杂的,不同的初始结构,TS结构也不同,
对于决速步来说,是只有一个
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李总把头    时间: 2021-4-6 21:52
您好 楼主 在使用Gaussian的时候优化复合物结构是怎么做到的呢 方便讲一下么  感谢
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19835675021    时间: 2021-12-20 17:12
lijiayisjtu 发表于 2019-10-15 19:36
势能面是 很复杂的,不同的初始结构,TS结构也不同,
对于决速步来说,是只有一个

由于初始结构的不同导致TS不同,请问楼主该如何选取反应前复合物和反应后复合物?
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lijiayisjtu    时间: 2021-12-20 19:35
19835675021 发表于 2021-12-20 17:12
由于初始结构的不同导致TS不同,请问楼主该如何选取反应前复合物和反应后复合物?

当时刚用Gaussian 遇到这样的问题,现在看这么选取:一个TS 走IRC 是有对应的产物和反应物的,能垒就根据这条IRC的算,不同起始结构 对应的TS自然不同,所以选取时 要保证反应物 TS 产物都是一一对应的
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19835675021    时间: 2021-12-20 21:53
lijiayisjtu 发表于 2021-12-20 19:35
当时刚用Gaussian 遇到这样的问题,现在看这么选取:一个TS 走IRC 是有对应的产物和反应物的,能垒就根据 ...

楼主,那反应复合物指的是哪部分的结构?




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