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标题: gromacs在能量最小化出现LINCS警告 [打印本页]

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Author: 青青青 时间: 2018-5-15 14:23
标题: gromacs在能量最小化出现LINCS警告
本帖最后由青青青于 2019-6-21 11:35 编辑

【求删除】gromacs能量最小化出现l了好多的LINCS警告，用的martini力场，constrain已经设置为none了，还是同样的问题。谢谢您的解答。
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作者
Author: sobereva 时间: 2018-5-15 19:58
重新编辑帖子。图没发上来。注意仔细阅读置顶的新人必读贴

作者
Author: beyond 时间: 2018-5-16 01:03
优化的时候，可以先试一下关闭 constraints

作者
Author: 青青青 时间: 2018-5-16 16:56

beyond 发表于 2018-5-16 01:03
优化的时候，可以先试一下关闭 constraints

constrain 已经设置none了。。

作者
Author: sobereva 时间: 2018-5-16 18:03
设置none不可能有这种提示

作者
Author: 青青青 时间: 2018-5-16 18:16

sobereva 发表于 2018-5-16 18:03
设置none不可能有这种提示

真的，intergrator设置的steep,把em.mdp给您看一下，谢谢您的回答。

作者
Author: 青青青 时间: 2018-5-16 18:17

sobereva 发表于 2018-5-15 19:58
重新编辑帖子。图没发上来。注意仔细阅读置顶的新人必读贴

新人必读帖刚刚读过啦，颇有启发。

作者
Author: sobereva 时间: 2018-5-16 18:26
用的是martini，这种重要信息在求助一开始就应当说明

作者
Author: 青青青 时间: 2018-5-16 19:19

sobereva 发表于 2018-5-16 18:26
用的是martini，这种重要信息在求助一开始就应当说明

不好意思，我重新编辑一下

作者
Author: 青青青 时间: 2018-5-16 19:22

sobereva 发表于 2018-5-16 18:26
用的是martini，这种重要信息在求助一开始就应当说明

请问老师是力场的问题吗？可是力场文件在别的体系里面模拟是没有错误的呀

作者
Author: maozh 时间: 2020-9-2 10:16
请问楼主这个问题怎么解决的呢？

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