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    <title>计算化学公社 - 第一性原理 (First-principles)</title>
    <link>http://bbs.keinsci.com/forum-105-1.html</link>
    <description>Latest 20 threads of 第一性原理 (First-principles)</description>
    <copyright>Copyright(C) 计算化学公社</copyright>
    <generator>Discuz! Board by Comsenz Inc.</generator>
    <lastBuildDate>Thu, 23 Apr 2026 16:13:08 +0000</lastBuildDate>
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      <title>计算化学公社</title>
      <link>http://bbs.keinsci.com/</link>
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    <item>
      <title>求助：VASP计算Co3O4slab模型的磁矩设置问题</title>
      <link>http://bbs.keinsci.com/thread-59070-1-1.html</link>
      <description><![CDATA[各位老师们好，在用vasp计算四氧化三钴时候，bulk计算可以根据配位环境选择对称原子来设置不同方向的磁矩；
然而在切完晶面之后变成slab模型底部的原子配位的氧原子数改变了（图2），这时候有点不明白应该如何设置磁矩去计算了。
目前尝试过直接前一半设置正的磁矩， ...]]></description>
      <category>第一性原理 (First-principles)</category>
      <author>zhj1023</author>
      <pubDate>Thu, 23 Apr 2026 11:06:52 +0000</pubDate>
    </item>
    <item>
      <title>求助超胞含缺陷的能带计算</title>
      <link>http://bbs.keinsci.com/thread-59067-1-1.html</link>
      <description><![CDATA[之前是拿原胞进行的测试，最开始计算超胞的，但是看了一些教程，不知道我这个计算过程是否正确。

原胞结构优化（ISIF=3）— 扩胞+缺陷结构优化（ISIF=2）— 自洽计算 — 非自洽计算（能带计算）

但是我其中两个结构在VASPKIT中，KPATH.in无生成内容，所以我采用Se ...]]></description>
      <category>第一性原理 (First-principles)</category>
      <author>Ying_Zhang</author>
      <pubDate>Thu, 23 Apr 2026 10:10:48 +0000</pubDate>
    </item>
    <item>
      <title>铁团簇吸附乙烷脱氢dimmer计算DIMCAR中仅有一行结果</title>
      <link>http://bbs.keinsci.com/thread-59066-1-1.html</link>
      <description><![CDATA[如题，在之前的帖子里我使用CI-NEB方法粗收敛+dimmer精收敛的方法计算铁13团簇吸附乙烷脱第二个氢原子的过渡态。在粗收敛阶段力都降低至0.5之后使用neb2dim.pl生成了dimmer的文件夹，并将CI-NEB计算的能量最高的结构作为dimmer的POSCAR，计算文件一并附上，dimmer在几次 ...]]></description>
      <category>第一性原理 (First-principles)</category>
      <author>177249249</author>
      <pubDate>Thu, 23 Apr 2026 06:25:03 +0000</pubDate>
    </item>
    <item>
      <title>求助使用cp2k算单点时生成的molden文件末尾出现NaN,载入服务器时出现unknown</title>
      <link>http://bbs.keinsci.com/thread-59061-1-1.html</link>
      <description><![CDATA[先是用OT优化了氢然后再用对角化算单点但是不收敛后面根据帖子的内容修改了一些参数之后一步收敛得到molden文件，然后用生成的molden文件去multiwfn画DOS但是载入之后选择DOS模块出现Unknown。另外，我还尝试过生成.cube文件去载入轨道信息来画DOS但还是失败了，还是出 ...]]></description>
      <category>第一性原理 (First-principles)</category>
      <author>DJJJJJJ</author>
      <pubDate>Thu, 23 Apr 2026 01:52:28 +0000</pubDate>
    </item>
    <item>
      <title>算吸附能时，怎么算OH的能量呢？是像算小分子一样吗？</title>
      <link>http://bbs.keinsci.com/thread-59055-1-1.html</link>
      <description><![CDATA[我看到一篇文献里算的OH的吸附能，请问怎么算OH的能量呢?是像算小分子一样吗？]]></description>
      <category>第一性原理 (First-principles)</category>
      <author>sqr</author>
      <pubDate>Wed, 22 Apr 2026 09:26:58 +0000</pubDate>
    </item>
    <item>
      <title>CeO2(100)晶面建模与氧空位形成能计算</title>
      <link>http://bbs.keinsci.com/thread-59046-1-1.html</link>
      <description><![CDATA[我用VASP计算CeO2不同晶面的氧空位形成能，用MS切的晶面，文献上(100)面的氧空位形成能是高于(110)的，可是我怎么计算都是(100)晶面的氧空位形成能更低，不知道是不是建模方面的问题，请各位老师指点一下。

U加了5，开了偶极校正，开了自旋，K点网络用的的1 1 1，我 ...]]></description>
      <category>第一性原理 (First-principles)</category>
      <author>Jihang</author>
      <pubDate>Wed, 22 Apr 2026 05:05:00 +0000</pubDate>
    </item>
    <item>
      <title>CINEB计算分子在MOFs材料中过孔能垒时能否将其中一个点单独优化后重启，缩短计算时间</title>
      <link>http://bbs.keinsci.com/thread-59031-1-1.html</link>
      <description><![CDATA[各位老师，我目前在用cp2k中的CINEB计算客体分子在MOFs材料中的扩散能垒，其中一种分子的能垒图有一个不自然的凸点（图1 Image11），随着计算的进行，该点能量有明显的下降趋势。我在想能否将该image11所对应的结构单独取出进行结构优化，然后将优化后的坐标填写的.rest ...]]></description>
      <category>第一性原理 (First-principles)</category>
      <author>ASC_Xiaotian</author>
      <pubDate>Tue, 21 Apr 2026 07:43:59 +0000</pubDate>
    </item>
    <item>
      <title>求助：NEB计算出现报错Fatal error in PMPI_Allreduce: Invalid communicator</title>
      <link>http://bbs.keinsci.com/thread-59029-1-1.html</link>
      <description><![CDATA[各位老师好，学生在使用VASP计算NEB时，先出现了application called MPI-abort process[/backcolor]这样的报错，并在插点文件夹03的stdout中看到Error EDDDAV: Call to ZHEGV failed. Returncode = 7 1 8报错信息 。查阅公社上帖子，将ALGO从默认改为fast,继续提交作业 ...]]></description>
      <category>第一性原理 (First-principles)</category>
      <author>radical</author>
      <pubDate>Tue, 21 Apr 2026 07:11:04 +0000</pubDate>
    </item>
    <item>
      <title>求助：计算稀土Lu的双核AIMD出现无法分配内存的报错</title>
      <link>http://bbs.keinsci.com/thread-59026-1-1.html</link>
      <description><![CDATA[各位老师，我现在需要计算双核稀土Lu的AIMD，一个节点大概有200G的内存。
一开始设置的单节点会内存分配报错，后来使用跨节点还是同样的报错。

服务器的物理核数一个节点是48核，有开超线程。
输入脚本，输入文件和报错信息已经附件上传，烦请各位老师指点！]]></description>
      <category>第一性原理 (First-principles)</category>
      <author>916990054</author>
      <pubDate>Tue, 21 Apr 2026 03:28:40 +0000</pubDate>
    </item>
    <item>
      <title>计算能带出现报错 KILLED BY SIGNAL: 9 (Killed)</title>
      <link>http://bbs.keinsci.com/thread-59023-1-1.html</link>
      <description><![CDATA[求助各位老师们，计算能带的过程中一直报错，不知道如何修改，请问一下是哪里出错了呀，附件附上我的INCAR,KPOINTS,POSCAR,POTCAR及输出文件，谢谢老师们]]></description>
      <category>第一性原理 (First-principles)</category>
      <author>绿色大豌豆</author>
      <pubDate>Tue, 21 Apr 2026 01:31:10 +0000</pubDate>
    </item>
    <item>
      <title>如何定量计算金属材料电子电导率electrical conductivity</title>
      <link>http://bbs.keinsci.com/thread-59011-1-1.html</link>
      <description><![CDATA[想请问大家有没有比较好的教程或者参考，使用VASP去计算electrical conductivity，即电子电导率，方法如下参考。已采用态密度和能带，大概定性看了一下金属的导电性，但是想更进一步的去计算，大家有没有如下的方法或者更好的方法去计算，感谢大家的意见。]]></description>
      <category>第一性原理 (First-principles)</category>
      <author>Ying_Zhang</author>
      <pubDate>Mon, 20 Apr 2026 09:46:28 +0000</pubDate>
    </item>
    <item>
      <title>基于VASP恒温分子动力学，NPG分子在相变温度，无法相变的问题</title>
      <link>http://bbs.keinsci.com/thread-59009-1-1.html</link>
      <description><![CDATA[基于VASP，在NPT系综下扩胞后的4×2×2 NPG体系分别进行分子动力学模拟。结果表明，在整个过程中体系未发生预期的相变。虑到NPG体系的相变由高温驱动，且其本质机制在于分子转动增强所引起的取向无序化，进而诱导晶格对称性的改变。为此，首先在NVT系综下开展高温分 ...]]></description>
      <category>第一性原理 (First-principles)</category>
      <author>lizhenhah</author>
      <pubDate>Mon, 20 Apr 2026 05:52:16 +0000</pubDate>
    </item>
    <item>
      <title>ZnNiLDH双层结构优化原子散开变形严重</title>
      <link>http://bbs.keinsci.com/thread-59008-1-1.html</link>
      <description><![CDATA[请教 ZnNiLDH的结构优化问题
之前是中间插层放入有机物难优化成功
现在优化未吸附有机物的基底结构，原子变化散开
inp文件见附件
部分inp，restart，优化完的out和未优化完的都在压缩包]]></description>
      <category>第一性原理 (First-principles)</category>
      <author>PoorChaos</author>
      <pubDate>Mon, 20 Apr 2026 05:20:33 +0000</pubDate>
    </item>
    <item>
      <title>第一性原理结构优化时赝势选择问题</title>
      <link>http://bbs.keinsci.com/thread-59007-1-1.html</link>
      <description><![CDATA[各位老师我想请问一下像VASP和CP2K这类第一性原理计算软件在计算的时候能像Gaussian一样结构优化时候选用较低精度的赝势进行，在算能量和能带分析的时候再选用高精度赝势吗？如果可以一般通过什么参数来判断这个赝势达到了满足结构优化的最低精度要求呢？]]></description>
      <category>第一性原理 (First-principles)</category>
      <author>KCM@SHU</author>
      <pubDate>Mon, 20 Apr 2026 02:44:14 +0000</pubDate>
    </item>
    <item>
      <title>求助QE中计算只含C, H, N的一维带电体系的设置</title>
      <link>http://bbs.keinsci.com/thread-58999-1-1.html</link>
      <description><![CDATA[大家好，我正在计算一个只含C, H, N的一维周期性体系，晶胞中含有两个正电荷（即total_charge = +2）。我想请问以下问题：
1. 使用QE计算，如何设置以避免体系与镜像的相互作用？查看文档，对于0维体系和2维体系，QE有MP/MT以及2D方法可以使用，对于1维体系，是否有比 ...]]></description>
      <category>第一性原理 (First-principles)</category>
      <author>DreamLight</author>
      <pubDate>Sat, 18 Apr 2026 16:30:47 +0000</pubDate>
    </item>
    <item>
      <title>VASP如何选择性地固定方向优化</title>
      <link>http://bbs.keinsci.com/thread-58991-1-1.html</link>
      <description><![CDATA[老师们好，请问VASP如何实现让基底中的中心金属原子和吸附物沿xyz方向完全弛豫，而基底中的其余原子仅沿x和y方向弛豫呀[/backcolor]]]></description>
      <category>第一性原理 (First-principles)</category>
      <author>伊莱亚斯</author>
      <pubDate>Sat, 18 Apr 2026 07:05:38 +0000</pubDate>
    </item>
    <item>
      <title>VASP: The old and the new charge density differ的解决方案</title>
      <link>http://bbs.keinsci.com/thread-58990-1-1.html</link>
      <description><![CDATA[今天使用VASP跑MD时，遇到这个问题，尝试了一堆方法都没用，后面发现这个方法非常有用，加进sh脚本直接解决了这个问题。神医]]></description>
      <category>第一性原理 (First-principles)</category>
      <author>PLwang</author>
      <pubDate>Sat, 18 Apr 2026 06:08:16 +0000</pubDate>
    </item>
    <item>
      <title>请问关于OOH在Pt111面上吸附的理论方法选择</title>
      <link>http://bbs.keinsci.com/thread-58988-1-1.html</link>
      <description><![CDATA[我使用PBED4组合对OOH在Pt111面上的吸附结构进行几何优化，得到的构型是接近平躺的结构，但很多文献例如N&#248;rskov 他们得到是明显立起来的top位点，用的是RPBE且那时还没有色散修正，而RPBE几乎不能描述弱相互作用，那这样的结构还可信吗？另外sob老师也说过DFT-D系 ...]]></description>
      <category>第一性原理 (First-principles)</category>
      <author>kogareru1z</author>
      <pubDate>Sat, 18 Apr 2026 03:38:17 +0000</pubDate>
    </item>
    <item>
      <title>求助：cp2k在计算带正电的体系时默认会自动加入均匀背景电荷来中和体系净电荷吗？</title>
      <link>http://bbs.keinsci.com/thread-58983-1-1.html</link>
      <description><![CDATA[各位老师，我研究了一个周期性体系来吸附带正电的离子，在做结构优化以及AIMD模拟都没有添加阴离子来中和净电荷（确实计算之初也未考虑到），现在审稿人提出疑问这个净电荷是如何处理的，所以我想确认一下cp2k自身是否就在计算的时候自动就加入均匀背景电荷进行中和了呢 ...]]></description>
      <category>第一性原理 (First-principles)</category>
      <author>Wenlin</author>
      <pubDate>Sat, 18 Apr 2026 00:10:43 +0000</pubDate>
    </item>
    <item>
      <title>求助：铁13团簇吸附乙烷脱氢计算过渡态收敛困难及频率计算咨询</title>
      <link>http://bbs.keinsci.com/thread-58981-1-1.html</link>
      <description><![CDATA[本贴咨询三个主要问题
1、本人在学习了论坛里过渡态计算的相关帖子后，尝试CI-NEB粗收敛+精收敛的方法计算过渡态，通常计算力可以很快收敛到0.1以下，但是继续计算可能出现迟迟无法达到收敛标准甚至是反弹的情况，附上计算的文件请帮忙看看有没有需要修改的内容。
2、 ...]]></description>
      <category>第一性原理 (First-principles)</category>
      <author>177249249</author>
      <pubDate>Fri, 17 Apr 2026 19:09:20 +0000</pubDate>
    </item>
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