计算化学公社»论坛首页 › 理论与计算化学 (Theoretical and Computational Chemistry) › 分子模拟 (Molecular Modeling) › 在模拟扩散系数时，建了5*5*5的盒子填进72个正庚烷分子 ...

在模拟扩散系数时，建了555的盒子填进72个正庚烷分子 108个接下来nvt跑了15000

查看数: 10838 | 评论数: 4 | 收藏 Add to favorites 0

关灯 | 提示：支持键盘翻页<-左右->

帖子模式

shanxitaiyuan

发布时间: 2018-5-18 09:58

正文摘要:

在模拟扩散系数时，建了5*5*5的file:///d:\Documents\Tencent Files\972306878\Image\C2C\296265DB90D5CD965562DE289622490A.jpg盒子填进72个正庚烷分子 108个十二烷分子，接下来nvt跑了15000步，最小化没问题，nvt ...

回复 Reply

sobereva 发表于 Post on 2018-5-23 18:39:30

VMD里可以显示多个镜像

再次提醒：
注意恰当命名标题
http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html

编辑帖子可以改标题

shanxitaiyuan 发表于 Post on 2018-5-21 09:09:18

shx 发表于 2018-5-18 17:20
这个是周期性边界条件的原因，你多显示几个盒子就可以看到这些分子已经聚集了。

我只建了一个盒子，怎么显示多个盒子呢命令怎么输

sobereva 发表于 Post on 2018-5-18 23:15:53

注意恰当命名标题
http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html

shx 发表于 Post on 2018-5-18 17:20:00

这个是周期性边界条件的原因，你多显示几个盒子就可以看到这些分子已经聚集了。

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register

在模拟扩散系数时，建了5*5*5的盒子 填进72个正庚烷分子 108个接下来nvt跑了15000

正文摘要:

回复 Reply

在模拟扩散系数时，建了555的盒子填进72个正庚烷分子 108个接下来nvt跑了15000