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使用Multiwfn+VMD以原子着色方式表现原子电荷、自旋布居、电荷转移、简缩福井函数

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sobereva

发布时间: 2018-6-3 12:57

正文摘要:

使用Multiwfn+VMD以原子着色方式表现原子电荷、自旋布居、电荷转移、简缩福井函数Using Multiwfn+VMD to exhibit atomic charges, spin populations, charge tansfer and condensed Fukui function via coloring ato ...

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Acommunist 发表于 Post on 2024-10-21 10:32:56

sobereva 发表于 2024-10-20 10:16
这怎么就构成了用NPA电荷的理由？
一篇深入浅出、完整全面介绍原子电荷的综述文章已发表！
http://sobe ...

好的，谢谢老师

sobereva 发表于 Post on 2024-10-20 10:16:46

Acommunist 发表于 2024-10-18 16:56
老师，使用ADCH电荷绘制的着色图和NPA电荷数值差异较大，请问可以使用NPA电荷来绘制类似的着色图嘛

这怎么就构成了用NPA电荷的理由？
一篇深入浅出、完整全面介绍原子电荷的综述文章已发表！
http://sobereva.com/714（http://bbs.keinsci.com/thread-46067-1-1.html）
上文介绍的我的综述文末的测试充分体现了ADCH能够很合理展现体系的电荷分布。

Acommunist 发表于 Post on 2024-10-18 16:56:41

老师，使用ADCH电荷绘制的着色图和NPA电荷数值差异较大，请问可以使用NPA电荷来绘制类似的着色图嘛

陈丢丢 发表于 Post on 2018-6-20 21:10:43

sobereva 发表于 2018-6-20 17:18
8成是你用的Multiwfn太老
最新版本在读入.chg后，用那个选项导出的才是.pqr，老版本导出的是pdb

谢谢sobereva老师，我去官网下载了最新版本的Multiwfn，问题已解决。

sobereva 发表于 Post on 2018-6-20 17:18:53

陈丢丢发表于 2018-6-20 14:03
sobereva老师，您好，我按照您说的方法将.chg文件转换成.pqr文件，我转换的是C4H8，都是按照您这个步骤下来 ...

8成是你用的Multiwfn太老
最新版本在读入.chg后，用那个选项导出的才是.pqr，老版本导出的是pdb

陈丢丢 发表于 Post on 2018-6-20 14:03:13

sobereva老师，您好，我按照您说的方法将.chg文件转换成.pqr文件，我转换的是C4H8，都是按照您这个步骤下来的，但我转换成.pqr文件后，打开我自己转换的.pqr文件和您转换的.pqr文件比较，发现不一样，自旋布居那列显示都是为1，请问下老师我是哪里错了吗？我上传了我转换的C4H8.pqr的截图。

QQ图片20180620135603.png (33.13 KB, 下载次数 Times of downloads: 140)

dana19851128 发表于 Post on 2018-6-3 13:03:49

正好要用到，及时雨-sob

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