请问一下，利用惯性矩张量的本征矢矩阵来对各个原子的坐标做个线性变换，是用旋转矩阵的逆矩阵处理原子坐标么

给本文末尾又加入了一个文献中使用此功能的实例

做了一点小改动，可以在VMD显示输入以下代码，这样显示出来的红绿蓝，分别对应，new.pdb中的x，y， z, 当三者数值相差不大时，这样比较便于指认，不容易弄错

1. set lena [molinfo top get a]
   
2. set lenb [molinfo top get b]
   
3. set lenc [molinfo top get c]
   
4. set cenx [expr $lena/2]
   
5. set ceny [expr $lenb/2]
   
6. set cenz [expr $lenc/2]
   
7. draw color red
   
8. draw cylinder "0 $ceny $cenz" "$lena $ceny $cenz" radius 0.15 resolution 20
   
9. draw color green
   
10. draw cylinder "$cenx 0 $cenz" "$cenx $lenb $cenz" radius 0.15 resolution 20
    
11. draw color blue
    
12. draw cylinder "$cenx $ceny 0" "$cenx $ceny $lenc" radius 0.15 resolution 20

复制代码

个人认为，如果计算纯几何的主轴，应该把质量权重去掉，得到纯几何的坐标张量

sob老师您好，可否把本文用到的例子的pdb文件也上传一下，我想测试一下^_^

上次我做材料的室友让我帮他算一下分子长度，我实在是为难了