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使用molclus程序结合高斯程序做分子构象搜索,不知道怎样启动高斯文件

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发布时间: 2018-7-2 23:49

正文摘要:

本帖最后由 风飞 于 2018-7-2 23:57 编辑 老师:您好!我在做过渡态的计算,现在在算两种反应物的构型,想结合molclus程序进行计算,我的分子小,原子个数有7个,根据您的帖子,我已经设置了高斯的环境变量: 然 ...

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风飞 发表于 Post on 2018-7-4 23:26:23
sobereva 发表于 2018-7-3 00:35
提示得很明确,相关帖子里也写得很明确,你得首先产生记录了初始构型的traj.xyz文件(用动力学程序或者molc ...

老师,学会了,,谢谢您
sobereva 发表于 Post on 2018-7-3 00:35:24
提示得很明确,相关帖子里也写得很明确,你得首先产生记录了初始构型的traj.xyz文件(用动力学程序或者molclus自带的genmer、gentor),放在当前目录下,molclus才能运行

仔细阅读此文,了解molclus的思想和运行流程
使用molclus程序做团簇构型搜索和分子构象搜索
http://bbs.keinsci.com/thread-577-1-1.html

你当前机子里装的G09,你总得把settings.ini里的gaussian_path改成相应路径才行
你的GAUSS_EXEDIR环境变量设的也完全不对,要一个字一个字仔细阅读molclus帖子里的说明

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