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一些CDA和NBO的问题

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MCV
发布时间: 2015-5-5 22:15

正文摘要:

我理论基础挺差的,想请教看看我的理解是否正确 1. 看到的一些文献以d/b的值来判断sigma donation和pi back donation哪个比重更大,其中d b都是e的绝对值,multiwfn的cda中的sum b值为负是否也该取绝对值,或者不 ...

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MCV 发表于 Post on 2015-5-7 17:33:13
确实如您所说,fo1-8是N1 N3是绿色的,fo2-182的金属原子是蓝色的
sobereva 发表于 Post on 2015-5-7 17:24:46
你看一下片段1的8号轨道和片段2的182号轨道的图形是什么样的。
复合物轨道肯定看上去是相位匹配的,但如果两个片段轨道本来是以相位相反重叠,显然重叠积分为负,只不过由于它们在复合物轨道中组合系数一正一负,导致复合物轨道上看两个片段轨道是相位相符方式混合的。
sobereva 发表于 Post on 2015-5-7 06:33:16
搞不清楚你的数据,重叠积分是正是负、是大是小,和片段轨道的图形是能对应上的,结合图像会便于考察。
MCV 发表于 Post on 2015-5-6 20:25:27
谢谢sob的耐心指导
我这个情况应该是没有pi back donation,因为b很小(其实为绝对值较小的负值)

znsymmznn3zn-L2cdn
MO99-d
0.072267
0.043246
0.061773
0.027583
MO99-b
-0.0068
-0.00326
-0.00614
-0.00262
MO99-d-b
0.079066
0.046504
0.067914
0.030199
d sum
0.536431
0.466762
0.483678
0.403714
b sum
-0.12574
-0.0928
-0.11987
-0.144
d-b sum
0.637261
0.495398
0.545931
0.424001
ecda
0.763
0.5882
0.6658
0.568


那就直接说d sum了,从N3到M2L的sigma donation分别为0.536 0.467 0.484 0.404
然后就参照别人对b为负的说法
The computed  values  of  the  donation,  d and  back  donation  terms,  b indicates that charge is mainly transferred from N3- to M2L



用了您说的计算overlap的功能,一切都好(提醒下没用过的同学,MO1·=MO1,MO2·=MO2+MO1的90个轨道)
znsymmznn3zn-L2cdn
-0.44037
0.408627
0.434388
0.330866
znsymm居然是负的,而且看了下是8与所有轨道的整列数据中最负的,cda cda1 cda2 的原子排序没啥不同,不知道怎么回事,不过应该是正的
sobereva 发表于 Post on 2015-5-6 03:10:49
1 d,b并不应当取绝对值,一般为正,但符号也是允许的。但是d,b的负值并没有明确的物理含义,如果明显为负,可能基组不合理(特别是有弥散函数)、或者CDA设定有误、或者CDA本身就不很适合此情况(诸如极化过大,影响了电子转移的分析)。

2 r为正不应简单地理解为成键,为负也不能简单说是反键。r为正对应于那种双方都提供带着电子的轨道构成MO的情况,从计算公式上可以看出,计算r的时候双方都是占据轨道。而计算b,d的时候则是一方提供占据轨道另一方提供空轨道。所以配键和r没有什么联系。

3 原理上不好解释出什么

4 从图上你可以说是和dz2组合。但是毕竟这两个金属的dz2轨道的朝向并不是都冲着笛卡尔Z坐标轴,因此NPA分析给出是别的d轨道贡献,这是正常的。实际上,s轨道和一个dx2-y2组合,再加上其它轨道的参与,展现出来的图形就是这个样子。这是化学直觉、图形描述,以及程序的数值表达上的差异。

5 如果想讨论匹配程度,更合适的方法是看“4 Export overlap matrix between fragment orbitals”输出的重叠积分的大小。至于讨论N3反键轨道的转移走的电子量,就看d项就行了。

6 觉得哪些值得分析就分析哪些,绝对不限于前线轨道。后面图中那两个轨道没必要分析。

7 可以加和比较
至于对杂化的解释,可以根据结果说发现那样的规律,但能否解释键的强弱,这不好说。

8 这不好简单解释,这么一变结构也发生了不少畸变,情况比较复杂。

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