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如何从C60的cif导出晶胞坐标(cif中包含两种共振式)

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发布时间: 2018-7-22 11:15

正文摘要:

从CCDC数据库中已经得到了C60的cif,但当我弄到MS中处理后,发现每个球都是120个原子(即两个C60分子) 这两个C60几乎完全重合在一起了,手工删除不现实,可行的办法是通过修改cif达到一个球只显示一个C60分子 ...

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欣欣早日毕业 发表于 Post on 6 day ago
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-8-7 18:45
如果只是需要一个C60晶胞的话,换成COD数据库可以找到没有晶体学无序(不是“共振式”)的结构9011580( ...

太感谢您了!!请问我按照您的提示下载的那个结构是C60的fcc结构是吗?我想确认一下~我只想要一个fcc C60分子晶体,所以想跟您确认一下~
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 Post on 6 day ago
欣欣早日毕业 发表于 2025-8-7 18:16
请问您最后怎么操作的呢?

如果只是需要一个C60晶胞的话,换成COD数据库可以找到没有晶体学无序(不是“共振式”)的结构9011580(刚好也在http://sobereva.com/690第8节的示例文件里),没必要费心思处理1楼那个.cif文件。

至于有没有什么晶体学无序结构的软件操作通法,我就不清楚了。
欣欣早日毕业 发表于 Post on 6 day ago
请问您最后怎么操作的呢?
savorw 发表于 Post on 2018-7-24 16:34:23
看CIF肯定要用Mercury来打开,它也是CCDC上可以直接下的软件,打开后就是单个C60,PACKing后才会是多个。单个另存为其它想要的格式就取出来了。
luoj17 发表于 Post on 2018-7-23 21:23:23
用molecule或者olex打开试试。
sobereva 发表于 Post on 2018-7-22 14:03:26
直接把cif拖进chem3D里,就只显示一个C60

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