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Dmol3中计算福井函数求助

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发布时间: 2018-7-23 19:26

正文摘要:

各位前辈、老师好,因为研究方向涉及交叉学科,现初步接触分子模拟以及量子化学,现在主要使用Dmol3,希望能够请教一些问题,问题或许有些琐碎,麻烦了,谢谢! 目前我在计算单分子的福井函数,在此之前我看过公社 ...

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wangxiaofeng 发表于 Post on 2022-8-3 10:01:44
sobereva 发表于 2022-8-3 04:08
干嘛不自己搜?

我有搜到,想跟您确认一下是不是这个论坛,http://bbs.keinsci.com/thread-23990-1-1.html    麻烦老师了
sobereva 发表于 Post on 2022-8-3 04:08:15
wangxiaofeng 发表于 2022-8-2 20:46
好的,谢谢老师!请问Distortion-interaction分析论坛,可以分享一下网址吗?

干嘛不自己搜?
wangxiaofeng 发表于 Post on 2022-8-2 20:46:18
本帖最后由 wangxiaofeng 于 2022-8-2 20:49 编辑
sobereva 发表于 2022-8-1 21:59
得拿具体体系来说事
Multiwfn里大量成键分析也可能有用
Multiwfn支持的分析化学键的方法一览

好的,谢谢老师!请问Distortion-interaction分析论坛,可以分享一下网址吗?
sobereva 发表于 Post on 2022-8-1 21:59:53
wangxiaofeng 发表于 2022-8-1 09:38
好的,明白,谢谢老师!如果要研究两个氢转移过渡态的区别,除了若相互作用分析,NBO等一些常见方法,还 ...

得拿具体体系来说事
Multiwfn里大量成键分析也可能有用
Multiwfn支持的分析化学键的方法一览
http://sobereva.com/471http://bbs.keinsci.com/thread-12488-1-1.html
另外还有Distortion-interaction分析,论坛里有许多次讨论。
wangxiaofeng 发表于 Post on 2022-8-1 09:38:34
sobereva 发表于 2022-7-31 03:48
你所谓的“能量低的过渡态”意义不明,化学组成不等价的体系比较绝对能量没意义
如果你是指亲核反应的过 ...

好的,明白,谢谢老师!如果要研究两个氢转移过渡态的区别,除了若相互作用分析,NBO等一些常见方法,还能通过什么方法分析?
sobereva 发表于 Post on 2022-7-31 03:48:33
wangxiaofeng 发表于 2022-7-30 10:09
假如这是一个亲核反应,是不是能量低的过渡态亲核能力会比较强

你所谓的“能量低的过渡态”意义不明,化学组成不等价的体系比较绝对能量没意义
如果你是指亲核反应的过渡态势垒,势垒低也不代表亲核物质的亲核能力就一定强。因为也可能另一个反应物的亲电能力更强,或者位阻效应更小,或者亲核物质更容易离去等等。势垒高低是多方面因素综合的结果。
wangxiaofeng 发表于 Post on 2022-7-30 10:09:28
sobereva 发表于 2022-7-30 01:35
这反应和亲核能力没太大关系

假如这是一个亲核反应,是不是能量低的过渡态亲核能力会比较强
sobereva 发表于 Post on 2022-7-30 01:35:14
wangxiaofeng 发表于 2022-7-29 11:36
老师,您好!对于两个氢转移过渡态,我想比较他们的亲核能力强弱,同一零点,是不是能量低的过渡态亲核能 ...

这反应和亲核能力没太大关系
wangxiaofeng 发表于 Post on 2022-7-29 11:36:26

老师,您好!对于两个氢转移过渡态,我想比较他们的亲核能力强弱,同一零点,是不是能量低的过渡态亲核能力会比较强,可是我做出的结果却是能量高的氢的亲核能力比较强,这是什么原因呢?还是说过渡态的能量高低跟亲核能力强弱并没有关系?
wangxiaofeng 发表于 Post on 2022-7-29 10:07:19
sobereva 发表于 2022-7-29 01:44

Multiwfn直接给你了局部软度,没必要自己乘
比较数值相对正负而非绝对值

好的,谢谢老师!
sobereva 发表于 Post on 2022-7-29 01:44:32
wangxiaofeng 发表于 2022-7-28 22:00
老师,您好!您说比较不同分子的亲核活性是对比用局部软度,即福井函数乘上分子的全局软度,这个全局软度 ...


Multiwfn直接给你了局部软度,没必要自己乘
比较数值相对正负而非绝对值
wangxiaofeng 发表于 Post on 2022-7-28 22:00:45
本帖最后由 wangxiaofeng 于 2022-7-28 22:02 编辑
sobereva 发表于 2018-7-23 21:17
Dmol3对于分子体系计算来说是很烂而且又黑的程序,所以论坛里基本看不到Dmol3算福井函数的讨论

1 分子间 ...

老师,您好!您说比较不同分子的亲核活性是对比用局部软度,即福井函数乘上分子的全局软度,这个全局软度是指下图中红色标记出的软度吗?还有福井函数有正有负,在比较时是比较绝对值吗?比如a=-0.8和b=0.6,是a(绝对值)>b,还是b>a?


202207282201585517..png (30.34 KB, 下载次数 Times of downloads: 52)

202207282201585517..png
sobereva 发表于 Post on 2018-7-24 14:10:43
PinkP 发表于 2018-7-24 09:11
谢谢sob老师。我是看到有文献使用Dmol3做类似计算但不详细,在公社转了这些天其实我自己也隐约感觉做量化 ...


你参加一次科音初级量子化学培训班就知道Gaussian用起来有多简单。
也不知道怎么会有人觉得Dmol3比Gaussian用起来更简单,明明Gaussian才是所有主流量化程序里真正用起来最简单的,gview图形界面完爆M$
用Dmol3只会长期被蒙在鼓里,又弱又难用,文章也不好发。
PinkP 发表于 Post on 2018-7-24 09:11:28
sobereva 发表于 2018-7-23 21:17
Dmol3对于分子体系计算来说是很烂而且又黑的程序,所以论坛里基本看不到Dmol3算福井函数的讨论

1 分子间 ...

谢谢sob老师。我是看到有文献使用Dmol3做类似计算但不详细,在公社转了这些天其实我自己也隐约感觉做量化要换Gaussian,奈何有个执念,,总感觉Gaussian较深较难

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