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PySCF测评

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发布时间: 2018-8-1 05:38

正文摘要:

本帖最后由 Accelerator 于 2018-8-4 23:00 编辑     经大家指正并确认过后发现PySCF默认是全核并行的,因此实际上与Gaussian相比并无速度优势。     PySCF是用Python写的量子化学程序。程 ...

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j5888xm 发表于 Post on 2022-9-27 13:17:59
zjxitcc 发表于 2022-9-27 12:41
官方没有推出PDF,都是在线的https://pyscf.org/user.html#

好的,谢谢您
zjxitcc 发表于 Post on 2022-9-27 12:41:29
j5888xm 发表于 2022-9-27 11:50
大佬有2.0的新版pdf说明书吗,感谢

官方没有推出PDF,都是在线的https://pyscf.org/user.html#
j5888xm 发表于 Post on 2022-9-27 11:50:54
我本是个娃娃 发表于 2018-8-2 15:14
传一个Pyscf 1.4版本的说明书

大佬有2.0的新版pdf说明书吗,感谢
hebrewsnabla 发表于 Post on 2021-9-4 21:50:21
zkzk1234 发表于 2021-9-4 18:34
如果手动编译调用一些intel的数据库,不知道会不会快一点.

默认编译方式就是使用intel数学库的,如果cmake能找得到的话。

conda安装的话,也是链接intel数学库的。
zkzk1234 发表于 Post on 2021-9-4 18:34:44
如果手动编译调用一些intel的数据库,不知道会不会快一点.
jiangning198511 发表于 Post on 2020-11-6 13:55:25
Kirisame_Sakuya 发表于 2020-11-6 12:59
找到一份pyscf的中文文档,里面比较详细地介绍了pyscf的主要功能,并且利用pyscf的接口实现了XYG3解析梯度 ...

好东西 感谢
Kirisame_Sakuya 发表于 Post on 2020-11-6 12:59:19
找到一份pyscf的中文文档,里面比较详细地介绍了pyscf的主要功能,并且利用pyscf的接口实现了XYG3解析梯度,对学习pyscf以及对自己亲手实现理论感兴趣的同学很有帮助。

https://py-xdh.readthedocs.io/zh_CN/latest/

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函数与激情 发表于 Post on 2020-6-16 14:40:21
本帖最后由 函数与激情 于 2020-6-16 14:41 编辑
zjxitcc 发表于 2020-6-16 13:52
没看懂你到底想算哪两个态。PySCF给出的两个根是最低的三重态和单重态,注意看自旋。在不同的程序中,有 ...

MOLCAS和MOLPRO的输入这里我没贴,两者用的都是S0,S1两态平均,PYSCF之前没接触过,在example里面找的输入,应该是没有使用态平均的,使用state_specific分别对于0和1。
zjxitcc 发表于 Post on 2020-6-16 13:52:22
函数与激情 发表于 2020-6-16 12:29
由于我要计算一个相对较大分子的CASSCF梯度能量,传说Pyscf CASSCF效率不错,因此尝试一下下看看效果咋样 ...

没看懂你到底想算哪两个态。PySCF给出的两个根是最低的三重态和单重态,注意看自旋。在不同的程序中,有的时候可以限制所有根均为单重态做计算,有的时候也可以不限制。看实际问题。
而且就算是S0/S1,也最好用态平均。看不出你几个软件分别用的是特定态还是态平均。
函数与激情 发表于 Post on 2020-6-16 12:29:32
zjxitcc 发表于 2020-6-15 23:53
先说说看能量差多少

由于我要计算一个相对较大分子的CASSCF梯度能量,传说Pyscf CASSCF效率不错,因此尝试一下下看看效果咋样 我先简单测试了个丙烯醛小分子之前优化出来的S1S0交叉结构处的能量和梯度,和MOLCAS和MOLPRO对比了一下。结果如图所示,三者的能量都满足S1和S0近简并的这个趋势,MOLCAS和MOLPRO的能量和梯度结果差别是很小的,pyscf S1处的梯度也还好吧,但怎么感觉和S0一样,不确定S0是不是我算错了呀,求大神指导一下。

grad.py

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zjxitcc 发表于 Post on 2020-6-15 23:53:15
函数与激情 发表于 2020-6-15 22:58
简单测试了下PySCF CASSCF的梯度和MOlcas的CASSCF梯度 发现差别有点大啊

先说说看能量差多少
函数与激情 发表于 Post on 2020-6-15 22:58:52
简单测试了下PySCF CASSCF的梯度和MOlcas的CASSCF梯度 发现差别有点大啊
k64_cc 发表于 Post on 2018-8-13 12:05:51
然而他们其实是拿这个研究postHF的……

PySCF的MP2效率倒是比Gaussian要高,不知道和ORCA比如何。
pyscf 发表于 Post on 2018-8-5 02:41:26
Accelerator 发表于 2018-8-4 22:59
感谢大家的更正。重新看了一下应该确实是默认全核并行的。这样的话PySCF实际上应该没有什么速度优势。

吹上了天 呵呵
本尊都没出来吹

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