beyond 发表于 2018-8-3 18:49 完整的命令应该是什么呢？ |
| 这个问题现在也深深的困扰着我，一些计算机上的名词搞不懂什么意思，试了一堆不是报错就是各种提示 |
beyond 发表于 2018-8-3 18:49 抱歉我在使用gromacs5.0.7时遇到了同样的问题（超算上自带版本较老），最早也是觉得加 -np 2 就可以，但是加了以后仍然会有同样的错误，不知道是不是版本的问题 Using 1 MPI process Using 12 OpenMP threads 2 GPUs detected on host gpu01.hpc.pku.edu.cn: #0: NVIDIA Tesla P100-PCIE-16GB, compute cap.: 6.0, ECC: yes, stat: compatible #1: NVIDIA Tesla P100-PCIE-16GB, compute cap.: 6.0, ECC: yes, stat: compatible 2 GPUs user-selected for this run. Mapping of GPUs to the 1 PP rank in this node: #0, #1 ------------------------------------------------------- Program gmx_mpi, VERSION 5.0.7 Source code file: /gpfs/share/packages/gromacs/5.0.7-gpu/src/gromacs/gmxlib/gmx_detect_hardware.c, line: 357 Fatal error: Incorrect launch configuration: mismatching number of PP MPI processes and GPUs per node. gmx_mpi was started with 1 PP MPI process per node, but you provided 2 GPUs. For more information and tips for troubleshooting, please check the GROMACS website at http://www.gromacs.org/Documentation/Errors ------------------------------------------------------- 我也尝试了不去指定gpu，但是很尴尬的是两个进程都默认使用了gpu0（并且默认每个进程都用了所有的核） |
beyond 发表于 2018-8-3 18:49 非常感谢 |
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