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通过SMD溶剂模型描述离子液体溶剂环境的方法

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发布时间: 2018-8-7 07:50

正文摘要:

通过SMD溶剂模型描述离子液体溶剂环境的方法The method to describe solvent environment of ionic liquid via SMD solvation model 文/Sobereva @北京科音  2018-Aug-7 离子液体已被广泛作为溶剂 ...

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wsly 发表于 Post on 2023-4-5 19:08:24
想找离子液体[P6,6,6,14][NTf2]的全部参数
Lemon97z 发表于 Post on 2022-12-2 09:28:09
sobereva 发表于 2022-12-2 02:30
极性和非极性参数在确定的时候多多少少会存在一定彼此间耦合。但对于你的情况,eps除了这个值也没更好的选 ...

好的,谢谢老师的回答!
sobereva 发表于 Post on 2022-12-2 02:30:38
Lemon97z 发表于 2022-12-1 10:57
老师那如果只是针对极性部分呢,比如 在IEFPCM中我可以假设离子液体的介电常数为11.5吗?
极性和非极性参数在确定的时候多多少少会存在一定彼此间耦合。但对于你的情况,eps除了这个值也没更好的选择(除非做分子动力学计算eps,但过程略麻烦)
Lemon97z 发表于 Post on 2022-12-1 10:57:04
sobereva 发表于 2022-12-1 05:27
这是两码事。IEFPCM溶剂模型没直接定义非极性部分,自然也不可能用文中的参数

老师那如果只是针对极性部分呢,比如 在IEFPCM中我可以假设离子液体的介电常数为11.5吗?
sobereva 发表于 Post on 2022-12-1 05:27:58
Lemon97z 发表于 2022-11-30 20:14
老师,我想请问一下这里离子液体的参数能适用于IEFPCM溶剂模型吗?

这是两码事。IEFPCM溶剂模型没直接定义非极性部分,自然也不可能用文中的参数
Lemon97z 发表于 Post on 2022-11-30 20:14:03
老师,我想请问一下这里离子液体的参数能适用于IEFPCM溶剂模型吗?
MiaoZuo 发表于 Post on 2022-11-27 11:32:23
chands 发表于 2022-11-27 11:24
如果不确定就算一下。其实很多配合物的电子排布是清楚的,或者有实验磁矩数据,就不用算两个。某些物质的 ...

谢谢大佬~~
chands 发表于 Post on 2022-11-27 11:24:11
MiaoZuo 发表于 2022-11-27 11:17
不好意思打错字了,就是在这边看到了才问一下。那是否需要分别计算2和6的单点能才可以判断?

如果不确定就算一下。其实很多配合物的电子排布是清楚的,或者有实验磁矩数据,就不用算两个。某些物质的高自旋态和低自旋态的能量相差很小,就两个都要考虑。
MiaoZuo 发表于 Post on 2022-11-27 11:17:40
chands 发表于 2022-11-27 10:54
你的问题严重歪楼,不应该发到这里。
是自旋多重度不是自选多重度

不好意思打错字了,就是在这边看到了才问一下。那是否需要分别计算2和6的单点能才可以判断?
chands 发表于 Post on 2022-11-27 10:54:03
MiaoZuo 发表于 2022-11-27 10:29
三价铁是不是应该用高自选多重度6来计算啊社长?

你的问题严重歪楼,不应该发到这里。
自旋多重度不是自选多重度

看情况,如果强场配体可能是低自旋。
MiaoZuo 发表于 Post on 2022-11-27 10:29:30
sobereva 发表于 2022-4-21 06:24
没任何问题
注意引用的基组文件末尾是否有空行,多空哪怕一行就没法读入溶剂设置

三价铁是不是应该用高自选多重度6来计算啊社长?
sobereva 发表于 Post on 2022-4-21 06:24:42
Dyyyzz 发表于 2022-4-20 10:41
我按照http://sobereva.com/g09/m_input.htm里面说的gen在前,scrf=read在后的顺序写了输入文件并相应添 ...
  1. #p pbe1pbe/gen opt freq em=gd3 scrf(pcm,read,solvent=generic)

  2. Title Card Required

  3. 0 2
  4. Fe                 0.00000000    0.00000000   -0.03726500
  5. Cl                 0.00000000    0.00000000   -1.97726500
  6. Cl                 0.00000000    1.77120634    0.78922668
  7. Cl                 0.00000000   -1.77120634    0.78922668

  8. Fe
  9. def2SVP
  10. ****
  11. Cl
  12. def2SVP
  13. ****

  14. eps=11.5
  15. epsinf=2.0449

复制代码


没任何问题
注意引用的基组文件末尾是否有空行,多空哪怕一行就没法读入溶剂设置

另外,绝对不要用M06-2X优化过渡金属配合物,此文明确说了
简谈量子化学计算中DFT泛函的选择
http://sobereva.com/272http://bbs.keinsci.com/thread-536-1-1.html

Dyyyzz 发表于 Post on 2022-4-20 10:41:49
sobereva 发表于 2022-4-19 18:17
看http://sobereva.com/g09/m_input.htm里关于从末尾读取不同字段的顺序关系,按顺序写,每个字段之间有 ...

我按照http://sobereva.com/g09/m_input.htm里面说的gen在前,scrf=read在后的顺序写了输入文件并相应添加了空行,但还是不能成功计算,输出文件中提示没有定义eps,请老师指教。
输入文件:
%chk=FeCl3.chk
%nprocshared=20
%mem=5GB
#p m062x/gen opt freq em=gd3 scrf(pcm,read,solvent=generic)

Title Card Required

0 2
Fe                 0.00000000    0.00000000   -0.03726500
Cl                 0.00000000    0.00000000   -1.97726500
Cl                 0.00000000    1.77120634    0.78922668
Cl                 0.00000000   -1.77120634    0.78922668

@/home/admin/txls/ma-TZVP.txt/N

eps=11.5
epsinf=2.0449


输出文件末:
Using the following non-standard input for PCM:
--- end of non-standard input.
Must specify Eps for generic solvent.
Error termination via Lnk1e in /home/admin/software/gaussian/g09/l301.exe at Wed Apr 20 10:34:37 2022.
Job cpu time:       0 days  0 hours  0 minutes 55.3 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=      5 Int=      0 D2E=      0 Chk=      7 Scr=      1
sobereva 发表于 Post on 2022-4-19 18:17:48
Dyyyzz 发表于 2022-4-19 10:13
sob老师,请问如果在定义了溶剂模型下还要给def2基组添加弥散函数,使用《给def2以ma-方式加弥散函数的Gaus ...

http://sobereva.com/g09/m_input.htm里关于从末尾读取不同字段的顺序关系,按顺序写,每个字段之间有一个空行

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