winnerwill 发表于 2020-6-26 05:39
一直奇怪我怎么改GAUSS_PDEF，cubegen的调用核数始终与nthreads保持一致的。原来Multiwfn调用cubegen是直接 ...

这个对实际应用不会造成太大不便。
让用户去设GAUSS_PDEF的话，给初学者去说明怎么设环境变量很费劲，初学者还很可能忽略掉

一直奇怪我怎么改GAUSS_PDEF，cubegen的调用核数始终与nthreads保持一致的。原来Multiwfn调用cubegen是直接用nthreads这一变量来控制的（ncubegenthreads=nthreads）。感觉是不是要由GAUSS_PDEF控制会好点，即（ncubegenthreads=GAUSS_PDEF）。这样，当cubegen需要减少并行核数来增加平均内存的时候，Multiwfn前面的其他步骤仍可以有更多的核数来运行。

谢谢sob

wuzhiyi 发表于 2019-4-26 00:37
一开始以为是弥散函数的问题，现在发现是cp的问题，嫁了cp之后，Total SCF Density就没了，而cubegen依赖To ...

Multiwfn从fch里载入的是轨道信息，不直接使用其中的密度矩阵，所以fch里没有密度矩阵时也可以计算静电势

counterpoise任务产生的chk绝对不要用于波函数分析目的，否则结果可能没意义

CHELPG、RESP等都是基于实空间函数（静电势）计算的，完全不怕弥散函数，而且带了弥散函数结果会更好些

关于做分析能不能带弥散函数这点详见此文Q36
Multiwfn FAQ
http://sobereva.com/452

一开始以为是弥散函数的问题，现在发现是cp的问题，嫁了cp之后，Total SCF Density就没了，而cubegen依赖Total SCF Density。
Multiwfn居然可以在没有Total SCF Density的时候计算静电势。。。

想问一下我对一个东西算单点# M062X/gen EmpiricalDispersion=GD3 Counterpoise=3
然后想用Multiwfn借用cubegen来计算原子电荷
却出现错误
Running: /system/software/linux-x86_64/gaussian/g16/A.03__pgi_16.5__atlas/g16/cubegen    4 potential=SCF "HIP_E127_Y158H.fch" ESPresult.cub -5 h < cubegenpt.txt > nouseout
sh: line 1:  3382 Segmentation fault      (core dumped) /system/software/linux-x86_64/gaussian/g16/A.03__pgi_16.5__atlas/g16/cubegen 4 potential=SCF "HIP_E127_Y158H.fch" ESPresult.cub -5 h < cubegenpt.txt > nouseout
在nouseout文件里显示
Will use up to     4 threads.
Top CubeGen          Thu Apr 25 15:57:34 2019
Aft UFChkP           Thu Apr 25 15:58:09 2019      139.98 cpu,       34.99 elapsed
Could not find " ","Total SCF Density" on formatted checkpoint file.
Error termination via Lnk1e at Thu Apr 25 15:58:10 2019.
想问一下这如何解决？ 谢谢
因为体系中有负电荷所以算结合能的时候加上了弥散，我知道如果算Mulliken的话，不能加弥散，但不太清楚算MK，CHELPG或者RESP的时候，加弥散有没有坏处，因为单点已经算好了，所以想能不能循环利用一下chk文件。

15whyhq 发表于 2019-4-18 16:52
cubegenpath路径是服务器装g16的路径吗？

不是路径，而是要指向g16那个可执行文件名

sobereva 发表于 2018-9-14 05:20
没版本的事，Multiwfn调用不了cubegen纯粹是cubegenpath路径没写对而已

cubegenpath路径是服务器装g16的路径吗？

tianpingpei 发表于 2018-9-13 14:05
sob老师，我下载最新的Multiwfn，计算高斯得到fchk文件，显示the cubegen can not be found,我的高斯是09w ...

没版本的事，Multiwfn调用不了cubegen纯粹是cubegenpath路径没写对而已

tianpingpei 发表于 2018-9-13 11:46
sob老师，请问一下，高斯处理chk文件的时候，必须等高斯计算完毕吗？不能设定参数后，高斯计算几分钟，然后 ...

显然不行
思路清奇

sob老师，我下载最新的Multiwfn，计算高斯得到fchk文件，显示the cubegen can not be found,我的高斯是09w版本的，然后我尝试把settings_ini文件中的您的高斯位置在d盘，我改成我的高斯安装位置c盘，还是显示thecubegen can not be found，是什么原因无法调用cubegen，是高斯版本的原因还是设置原因？

sob老师，请问一下，高斯处理chk文件的时候，必须等高斯计算完毕吗？不能设定参数后，高斯计算几分钟，然后强行终止，利用产生的chk文件转化为fch文件后在Multiwfn中计算吗？

太感谢了，真的是快了

今日又更新了Multiwfn，同步地更新了本帖。settings.ini里增加了cubegendenstype参数，可以设定cubegen利用.fch里哪个级别的密度矩阵来计算静电势。而且还支持了借用cubegen计算TrEsp原子跃迁电荷，用此电荷可以快速而且校准地计算激子耦合能。