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Gaussian势能面扫描问题

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发布时间: 2018-9-3 08:25

正文摘要:

本帖最后由 lijiaqi 于 2018-9-4 08:36 编辑 [url=]acs.jpcc.8b05105.pdf[/url]对于文献中势能面柔性扫描,我用关键词#p opt=modredundant m06/6-31g(d,p)    末尾设置二面角变化 13 29 30 32 S 6 3 ...

回复 Reply

lijiaqi 发表于 Post on 2020-12-20 14:48:33
秦宁 发表于 2020-12-18 21:48
您好,我看您之前咨询过做完柔性扫描后无法查看scan图,后面有解决吗,可以告诉我一下吗?

我自己做扫描,关键词相同,使用笛卡尔坐标,正常结束且可以查看扫描结果
秦宁 发表于 Post on 2020-12-18 21:48:39
您好,我看您之前咨询过做完柔性扫描后无法查看scan图,后面有解决吗,可以告诉我一下吗?
Regina 发表于 Post on 2018-12-27 09:59:16
sobereva 发表于 2018-12-25 01:03
解决SCF不收敛问题的方法
http://sobereva.com/61

好的,我试试
sobereva 发表于 Post on 2018-12-25 01:03:46
Regina 发表于 2018-12-24 10:53
请问你们有做过激发态氢键键长的势能面扫描的吗,总是出现l502错误,是怎么回事呢?

解决SCF不收敛问题的方法
http://sobereva.com/61
Regina 发表于 Post on 2018-12-24 10:53:45
请问你们有做过激发态氢键键长的势能面扫描的吗,总是出现l502错误,是怎么回事呢?
lijiaqi 发表于 Post on 2018-9-4 08:38:07
三石草祭 发表于 2018-9-3 12:07
四个构象需要手动调整二面角优化,给体和受体面面分布的有两个,垂直分布的有两个,关于你说的柔性扫描无 ...

好的,非常感谢,我去看下过渡态知识,麻烦你再帮忙看下柔性扫描,文件已上传。谢谢
三石草祭 发表于 Post on 2018-9-3 12:07:51
lijiaqi 发表于 2018-9-3 11:12
请问TS是什么方式呢?非常感谢

四个构象需要手动调整二面角优化,给体和受体面面分布的有两个,垂直分布的有两个,关于你说的柔性扫描无法读取的问题,可以上传输出文件。关于过渡态的知识,可以参照sob老师的帖子http://sobereva.com/44
lijiaqi 发表于 Post on 2018-9-3 11:12:29
sobereva 发表于 2018-9-3 10:24
注意求助帖应当在帖子标题明确体现出提问、求助(见http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html),给你 ...

好的,谢谢老师
lijiaqi 发表于 Post on 2018-9-3 11:12:13
三石草祭 发表于 2018-9-3 09:57
正如楼上两位师兄所说的,先找到这四个构象,然后寻找两个构象之间的过渡态,不过在寻找过渡态时,和楼主想 ...

请问TS是什么方式呢?非常感谢
lijiaqi 发表于 Post on 2018-9-3 11:11:10
小范范1989 发表于 2018-9-3 09:47
这个图应该不是柔性扫描出来的。
和楼上所说,是先找出四个构型,然后找的过渡态好像是。

谢谢,文章说是做了柔性扫描,我想再问下柔性扫描我的关键词没有问题,最终也正常结束,但是在高斯view看不到,这个是怎么出错了?谢谢师兄
lijiaqi 发表于 Post on 2018-9-3 11:08:37
xujian 发表于 2018-9-3 09:01
算出四种构象,然后找到对应构象之间转化的过渡态即可作出此图

好的,谢谢,请问最初四种构想怎么确定呢?自己固定的二面角吗?过渡态要怎么去找呢?非常感谢
sobereva 发表于 Post on 2018-9-3 10:24:22
注意求助帖应当在帖子标题明确体现出提问、求助(见http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html),给你改了
三石草祭 发表于 Post on 2018-9-3 09:57:07
本帖最后由 三石草祭 于 2018-9-3 09:58 编辑
小范范1989 发表于 2018-9-3 09:47
这个图应该不是柔性扫描出来的。
和楼上所说,是先找出四个构型,然后找的过渡态好像是。
正如楼上两位师兄所说的,先找到这四个构象,然后寻找两个构象之间的过渡态,不过在寻找过渡态时,和楼主想的一致,进行了柔性扫描的方式,大概确定了过渡态的位置,然后通过TS的方式得到,寻找过渡态,初猜结构是关键,柔性扫描可以很好的帮助你找到这个结构
小范范1989 发表于 Post on 2018-9-3 09:47:36
这个图应该不是柔性扫描出来的。
和楼上所说,是先找出四个构型,然后找的过渡态好像是。

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