YzChen 发表于 2022-5-2 20:49
请问如果用vmd作aim分析的图，结果发现里面的原子指认错误，这要如何解决呢

说具体什么叫原子指认错误

请问如果用vmd作aim分析的图，结果发现里面的原子指认错误，这要如何解决呢

根据用户的要求，今天更新的Multiwfn里的AIM.vmd新定义了labcpidx命令，对本文新加入了以下内容

AIM.vmd里还定义了标记特定序号的临界点的命令labcpidx，用法为labcp [序号] [文字尺寸] [偏移量X] [偏移量Y]。例如labcpidx "3 6 to 8 12 15" 2.1就代表把3、6、7、8、12、15号原子的标签以2.1的字号显示出来。

更新了此文，加入了如何只显示或不显示特定键径的说明。

鉴于有时有人问在使用本文的方法时怎么只显示出特定的临界点，在本文文末专门添加了说明。

liuyjhx 发表于 2019-3-26 10:00
老师您VMD用的是哪一个版本呢？我就是按照这个说明操作，还是上面的错误，唯一的区别就是发现和您用的VMD ...

VMD 1.9.3

sobereva 发表于 2019-3-25 17:08
肯定vmd.rc没改对。改完了没保存或者没重启VMD。正确过程视频里体现得很清楚

老师您VMD用的是哪一个版本呢？我就是按照这个说明操作，还是上面的错误，唯一的区别就是发现和您用的VMD软件版本不同

liuyjhx 发表于 2019-3-25 13:28
老师我每次输入这个都是错误的提示
vmd > aim
invalid command name "aim"

肯定vmd.rc没改对。改完了没保存或者没重启VMD。正确过程视频里体现得很清楚

liuyjhx 发表于 2019-3-25 13:33
我找“编辑VMD.bat，把里面的1.fch改为GC.wfn，然后双击VMD.bat”中的VMD.bat怎么找不到，所以我就理解为 ...

就是AIM.bat。文中已改

liuyjhx 发表于 2019-3-25 13:28
老师我每次输入这个都是错误的提示
vmd > aim
invalid command name "aim"

我找“编辑VMD.bat，把里面的1.fch改为GC.wfn，然后双击VMD.bat”中的VMD.bat怎么找不到，所以我就理解为AIM.bat,按照这样的确是产生了CPprop.txt

sobereva 发表于 2018-10-16 13:18
Multiwfn直接显示的效果没差到哪去

老师我每次输入这个都是错误的提示
vmd > aim
invalid command name "aim"
这是我操作的步骤，您帮我看看哪里操作有误，谢谢您
1：把Multiwfn的examples\scripts目录下的AIM.bat和AIM.txt拷到Multiwfn可执行文件所在目录
2：编辑AIM.bat
修改如下：Multiwfn GC.wfn < AIM.txt
move /Y *.pdb "C:\Users\mayd\Desktop\VMD"
3：然后把AIM.vmd这个VMD绘图脚本文件拷到VMD目录下，在VMD目录下的vmd.rc文件末尾加入一行proc aim {} {source AIM.vmd}
4：用Multiwfn文件包里examples目录下的GC.wfn作为例子。把这个文件拷到Multiwfn可执行文件所在文件夹，编辑AIM.bat，把里面的1.fch改为GC.wfn，然后双击AIM.bat。当前目录下出现了CPprop.txt而且内容不为空正常算完了
6：然后启动VMD，在命令行窗口输入aim，这步就是不对每次都是这个都是错误的提示
vmd > aim
invalid command name "aim"

对本文和Multiwfn自带的AIM.vmd脚本进行了更新，现在可以一个命令就把临界点的序号直接标在图上，方便了很多

sobereva 发表于 2018-11-27 10:52
计算过程有问题
先手动在Multiwfn里做拓扑分析进行操作，确认对当前体系确实能搜索出临界点
并且保证输 ...

好的 ，谢谢sob老师

cep 发表于 2018-11-27 10:49
出现CPprop.txt但是是空的要咋整

计算过程有问题
先手动在Multiwfn里做拓扑分析进行操作，确认对当前体系确实能搜索出临界点
并且保证输入文件路径正确