XYZchemistry 发表于 2024-10-25 15:50
老师您好，我在绘制静电势着色的分子间范德华表面穿透图时，使用的是您压缩包中的1.fch和2.fch，我跑完了ES ...

仔细看帖子末尾的红字

老师您好，我在绘制静电势着色的分子间范德华表面穿透图时，使用的是您压缩包中的1.fch和2.fch，我跑完了ESP pt.bat，最后在VMD中输入pt2，提示cant read file，是怎么回事啊

Wright 发表于 2024-10-4 15:40
sob老师，双击espiso.bat, 只生成density.cub，不生成ESP.cub是怎么回事儿？

把帖子末尾的红字部分仔细看了，该说的都说了

sob老师，双击espiso.bat, 只生成density.cub，不生成ESP.cub是怎么回事儿？

奋斗者 发表于 2024-9-13 08:51
sob老师，我按照http://sobereva.com/443绘图，在vmd中输入pt,可以得到红蓝颜色的表面顶点结构图，但是输入 ...

远程说不清楚。换机子再试。如果cube文件很大，也尝试本论坛里VMD 1.9.3 64bit版

sob老师，我按照http://sobereva.com/443绘图，在vmd中输入pt,可以得到红蓝颜色的表面顶点结构图，但是输入iso，只能得到灰白色静电势等值面图，使用的是普通版vmd，GLSL也默认打开，还有其他解决方法吗？

奋斗者 发表于 2024-9-3 20:57
请问你解决这个问题了吗，我也存在该问题，GLSL默认是打开的

换了台电脑就好了。

daanyueluo 发表于 2024-5-9 16:55
sob老师，我这个静电势图画了两天了，总有这个问题，在VMD软件输入iso这一步，然后就生成灰白色的图，已经 ...

请问你解决这个问题了吗，我也存在该问题，GLSL默认是打开的

一条君 发表于 2024-6-28 21:17
老师，继续#14楼的问题【请问下sob老师，如果是计算有机分子在水溶液中的静电势，在计算的时候是不是要选 ...

没那么严格要求，横向对比时用的等值面数值统一即可。而且跟介电常数没有任何直接联系

sobereva 发表于 2019-3-28 02:57
建议如此

老师，继续#14楼的问题【请问下sob老师，如果是计算有机分子在水溶液中的静电势，在计算的时候是不是要选择范德华等值面为0.002a.u.?】，请问在有机溶剂中的静电势，范德华表面也选0.002a.u.吗？还是一定介电常数以上的选0.002，一定介电常数以下的还是0.001呢，谢谢~

sobereva 发表于 2024-6-25 02:03
仔细看下文搞清楚批处理脚本运行机理
详谈Multiwfn的命令行方式运行和批量运行的方法
http://sobereva. ...

感谢老师，已经知道问题了，重试后做出来了

hiyoliknight 发表于 2024-6-24 09:42
请问老师,按照文章方法在运行iso.bat计算结束后，只出现了ESP文件，没有density文件，无法运行iso命令得到 ...

仔细看下文搞清楚批处理脚本运行机理
详谈Multiwfn的命令行方式运行和批量运行的方法
http://sobereva.com/612（http://bbs.keinsci.com/thread-24929-1-1.html）

自己在Multiwfn里输入批处理文件传给Multiwfn的所有命令，看屏幕提示弄清楚
不调用cubegen的情况下根本没必要转成fch，本来当前目的也没必要调用cubegen

请问老师,按照文章方法在运行iso.bat计算结束后，只出现了ESP文件，没有density文件，无法运行iso命令得到第二种静电势图是怎么回事？原子量比较大600个，是按照以前的博文，用xtb导出的molden.input文件，把它用multiwfn转成了fch文件计算的。pt命令能正常算出，得到第一种静电势图。感谢老师

daanyueluo 发表于 2024-5-9 16:55
sob老师，我这个静电势图画了两天了，总有这个问题，在VMD软件输入iso这一步，然后就生成灰白色的图，已经 ...

先打开GLSL再说
如果装的是CUDA版的，改成普通版

sob老师，我这个静电势图画了两天了，总有这个问题，在VMD软件输入iso这一步，然后就生成灰白色的图，已经尝试安装多次vmd1.9.3了，还是不管用。烦请sob老师和其他老师解答，感激不尽。