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PbS团簇应该怎么建模?通过genmer可以吗?

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发布时间: 2018-10-15 19:03

正文摘要:

请问,这种团簇应该怎么建模?通过genmer可以吗?

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didida 发表于 Post on 2018-10-16 08:30:40
sobereva 发表于 2018-10-16 01:05
你先找来PbS的晶体结构文件,然后用gview或M$之类延展成较大的复晶胞,保存成结构文件载入到VMD里,然后按 ...

好的,老师,我下次注意,非常感谢老师的回答。
didida 发表于 Post on 2018-10-16 08:30:05
coolrainbow 发表于 2018-10-15 23:09
ABCluster也可以很容易的做这个工作。不过它找的是全局极小点,显然不会是这中八个角都有凹面的结构。只有 ...

谢谢
didida 发表于 Post on 2018-10-16 08:29:55
卡开发发 发表于 2018-10-15 22:53
自己造可以这样造:
1、拿MS或者别的导入一个NaCl格子
2、Na->Pb,Cl->S

非常感谢
didida 发表于 Post on 2018-10-16 08:29:40

谢谢您,刚刚起步学习。
sobereva 发表于 Post on 2018-10-16 01:05:53
你先找来PbS的晶体结构文件,然后用gview或M$之类延展成较大的复晶胞,保存成结构文件载入到VMD里,然后按照http://bbs.keinsci.com/thread-11104-1-1.html的3L的做法抠出特定半径的球形即可。如果边边角角有不太合适的地方可以在gview里进一步修剪。

注意求助帖应当在帖子标题明确体现出提问、求助(见http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html),给你改了,望以后注意
coolrainbow 发表于 Post on 2018-10-15 23:09:11
ABCluster也可以很容易的做这个工作。不过它找的是全局极小点,显然不会是这中八个角都有凹面的结构。只有一个棱

卡开发发 发表于 Post on 2018-10-15 22:53:21
本帖最后由 卡开发发 于 2018-10-16 06:50 编辑

自己造可以这样造:
1、拿MS或者别的导入一个NaCl格子
2、Na->Pb,Cl->S
3、(QD1)取消周期性边界;(QD2)建立3x3x3超晶格,8个角每个各截去4个原子,取消周期性边界;(QD3)建立3x3x3超晶格,8个角各截去1个原子,取消周期性边界。

我本是个娃娃 发表于 Post on 2018-10-15 22:09:01
有那么难吗?
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