wangzh 发表于 2025-3-12 17:03
老师。您这里说的“orb：用来载入和显示轨道。比如你输入orb 33，就会载入VMD目录下的orb000033.cub，并把 ...

不熟悉VMD指令的话，建议读一读showorb.vmd里的代码结合doc/ug.pdf用户指南理解每一行指令作用，执行下述所有操作前也打开File - Log Tcl Commands to Console将对应的指令输出到VMD的命令行窗口查看。

先载入并显示orb000033.cub的轨道等值面，此时在Graphical Representations窗口给内相应体系应有两个Isosurface显示方式，分别对应orb000033.cub等值面的正和负区域。然后右键点击VMD主窗口相应体系选Load Data Into Molecule，点Browse选择orb000034.cub以将其加载到已有体系的molecule id内。
回到Graphical Representations窗口，分别选中已有的Isosurface显示方式并点击Create Rep，在新复制出来的显示方式中通过Vol切换等值面数据读取来源为orb000034.cub，再切换下着色方式的ColorID以区分轨道。
最终应有四个Isosurface显示方式，分别对应orb000033.cub的正区域、orb000033.cub的负区域、orb000034.cub的正区域、orb000034.cub的负区域，四个显示方式的ColorID各不相同，Isovalue绝对值相同但各有正负。
如果需要查看轨道重叠情况，可以将Material切换到透明的材质如EdgyGlass。

老师。您这里说的“orb：用来载入和显示轨道。比如你输入orb 33，就会载入VMD目录下的orb000033.cub，并把它的绘制方式修改为等值面图的形式。之后如果比如再输入orb 34，则33号轨道就会被撤销，而将orb00034.cub以等值面形式显示。”如果用博文的方法快速绘制轨道，我想同时显示33,34两个轨道，orb 输入会使第二个轨道撤销，请问有什么方法让两个轨道都产生吗？

sobereva 发表于 2025-2-18 16:28
VMD脚本没生效，vmd.rc没配置对或者脚本文件没放对位置

谢谢社长，我卸载重新装了一次就好了

wocaishiniu 发表于 2025-2-18 16:13
社长，在VMD里面出现了invalid command name "orb"，按照您提出的可能问题都排除了，还是这样，您看应该怎 ...

VMD脚本没生效，vmd.rc没配置对或者脚本文件没放对位置

社长，在VMD里面出现了invalid command name "orb"，按照您提出的可能问题都排除了，还是这样，您看应该怎么解决？

不错

sobereva 发表于 2022-9-15 02:52
使用Multiwfn+VMD快速地绘制高质量AIM拓扑分析图（含视频演示）
http://sobereva.com/445（http://bbs.k ...

好的，非常感谢，谢谢你

18208408959 发表于 2022-9-14 21:44
问一下multiwfn分析出来的nado轨道文件是mwfn文件，但是vmd不显示，怎么才可以显示呢，也不知道怎么修改vmd ...

使用Multiwfn+VMD快速地绘制高质量AIM拓扑分析图（含视频演示）
http://sobereva.com/445（http://bbs.keinsci.com/thread-11079-1-1.html）
用VMD绘制艺术级轨道等值面图的方法（含演示视频）
http://sobereva.com/449（http://bbs.keinsci.com/thread-11550-1-1.html）

按上文照常用Multiwfn+VMD绘制，只不过bat脚本里的输入文件改成记录NAdO的mwfn文件，要有举一反三的能力，搞清楚脚本运作机制，不懂的话仔细看下文。根本用不着改VMD脚本
详谈Multiwfn的命令行方式运行和批量运行的方法
http://sobereva.com/612（http://bbs.keinsci.com/thread-24929-1-1.html）

问一下multiwfn分析出来的nado轨道文件是mwfn文件，但是vmd不显示，怎么才可以显示呢，也不知道怎么修改vmd的脚本

哈哈，Sob社长速度好快， 我等懒人就先行谢过啦！补充几个图，丰富一下社长帖子的内容。

谢谢sob老师，简单易行

谢谢sob老师，懒人的福音。要是能把VMD的路径写进Multiwfn的setting文件里，就更懒了。

很不错！