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求做分子动力学模拟的大神指点：怎么做总能涨落随时间的变化

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1xiaohua1

发布时间: 2018-10-23 16:47

正文摘要:

本帖最后由 1xiaohua1 于 2018-10-23 19:05 编辑各位大神，想做重复下图中的Total energy fluctuations with respect to molecular dynamics simulation step 我的INCAR如下，需要修改吗？ SY ...

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李朋 发表于 Post on 2019-11-12 20:42:17

archer 发表于 2018-10-24 09:38
OSZICAR 里面有打印每步的能量，读取出来就行了。

OSZICAR里面会给出好几个能量值，请问哪一个是total potential energy呢？谢谢~

啦啦黑还黑 发表于 Post on 2018-10-26 17:22:10

VASP默认的控温方法是每一步直接把温度校正到你设定的值300K，破坏了md统计意义。
一般我们跑canonical ensemble的MD都需要热浴控温，看看手册MDALGO这个参数。

1xiaohua1 发表于 Post on 2018-10-24 14:15:04

archer 发表于 2018-10-24 09:38
OSZICAR 里面有打印每步的能量，读取出来就行了。

谢谢了

archer 发表于 Post on 2018-10-24 09:38:20

OSZICAR 里面有打印每步的能量，读取出来就行了。

1xiaohua1 发表于 Post on 2018-10-23 19:04:51

bluewhale 发表于 2018-10-23 17:07
做MD，涨落是正常的，不涨落是不正常的。

大神，我的INCAR 对吗？怎么画成那副图？

bluewhale 发表于 Post on 2018-10-23 17:07:02

做MD，涨落是正常的，不涨落是不正常的。

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