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请教高斯计算偶极矩结构优化文件和频率计算文件结果不一致问题

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发布时间: 2018-11-29 15:48

正文摘要:

本帖最后由 DUNING 于 2018-11-29 15:53 编辑 在激发态优化过程中由于软件问题不能opt+freq一起算,只能分开算。先算opt,后计算freq,但在两个结果log文件中偶极矩大小不一致,opt产生的log文件中偶极矩要比freq ...

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Changwenxu 发表于 Post on 2022-7-18 14:37:12
sobereva 发表于 2022-7-17 10:04
Tian Lu, Qinxue Chen, Zeyu Liu, A Thorough Theoretical Exploration of Intriguing Characteristics o ...

收到
sobereva 发表于 Post on 2022-7-17 10:04:40
Changwenxu 发表于 2022-7-16 18:34
one more question, 算logp想引用您的chemrixv 那篇算C18环的预印,不知道格式是什么?

Tian Lu, Qinxue Chen, Zeyu Liu, A Thorough Theoretical Exploration of Intriguing Characteristics of Cyclo[18]carbon: Geometry, Bonding Nature, Aromaticity, Weak Interaction, Reactivity, Excited States, Vibrations, Molecular Dynamics and Various Molecular Properties, ChemRxiv (2019) DOI: 10.26434/chemrxiv.11320130
Changwenxu 发表于 Post on 2022-7-16 18:34:40
sobereva 发表于 2022-7-16 09:00
对偶极矩精度要求高,而且算得动的话,建议用def2-TZVPD
结合SMD的话,用M05-2X/6-31G*,《谈谈隐式溶剂 ...

one more question, 算logp想引用您的chemrixv 那篇算C18环的预印,不知道格式是什么?
Changwenxu 发表于 Post on 2022-7-16 15:39:41
sobereva 发表于 2022-7-16 09:00
对偶极矩精度要求高,而且算得动的话,建议用def2-TZVPD
结合SMD的话,用M05-2X/6-31G*,《谈谈隐式溶剂 ...

收到!感谢S大
sobereva 发表于 Post on 2022-7-16 09:00:59
Changwenxu 发表于 2022-7-15 09:58
老师您好,1.如果我算普通全主族前三周期元素 小分子的基态偶极矩,能否用B3LYP/6-31G(d)优化完之后,再 ...

对偶极矩精度要求高,而且算得动的话,建议用def2-TZVPD
结合SMD的话,用M05-2X/6-31G*,《谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算》(http://sobereva.com/327)里说了
Changwenxu 发表于 Post on 2022-7-15 18:46:08
wzkchem5 发表于 2022-7-15 15:07
1. 可以,但假如分子特别小(比如20个原子以内),建议用大基组做优化,反正也跑得动;假如分子不是特别 ...

感谢!
wzkchem5 发表于 Post on 2022-7-15 15:07:36
Changwenxu 发表于 2022-7-15 02:58
老师您好,1.如果我算普通全主族前三周期元素 小分子的基态偶极矩,能否用B3LYP/6-31G(d)优化完之后,再 ...

1. 可以,但假如分子特别小(比如20个原子以内),建议用大基组做优化,反正也跑得动;假如分子不是特别小,结构优化时必须加色散校正。
2. 按http://sobereva.com/327计算
Changwenxu 发表于 Post on 2022-7-15 09:58:26
sobereva 发表于 2018-11-29 16:43
用优化完的结构,算单个结构的TDDFT,写诸如TD(root=x) PBE1PBE/6-31G* density,最后给出的偶极矩就是第x ...

老师您好,1.如果我算普通全主族前三周期元素 小分子的基态偶极矩,能否用B3LYP/6-31G(d)优化完之后,再用PBE0/def2TZVP来算偶极矩?2.如果还想算logP,您推荐什么类型的单点能计算使用基组来算 水、辛烷溶剂模型下吉布斯自由能差? 望您解惑
songster 发表于 Post on 2018-11-30 09:55:50
贴出输入文件才能讨论。   优化和频率计算   最重要的是频率用的是opt最后一步构型且保持关键词一致(除opt和freq外)   这样结果才有意义
sobereva 发表于 Post on 2018-11-29 23:08:39
DUNING 发表于 2018-11-29 16:57
好的,谢谢sob老师,请问如果是在溶剂当中的话,也是同样的方法吗?

是。但这是以最简单的方式考虑溶剂对溶质跃迁的响应的做法,还有更复杂、更耗时的特定态模型。
DUNING 发表于 Post on 2018-11-29 16:57:20
sobereva 发表于 2018-11-29 16:43
用优化完的结构,算单个结构的TDDFT,写诸如TD(root=x) PBE1PBE/6-31G* density,最后给出的偶极矩就是第x ...

好的,谢谢sob老师,请问如果是在溶剂当中的话,也是同样的方法吗?
sobereva 发表于 Post on 2018-11-29 16:43:32
用优化完的结构,算单个结构的TDDFT,写诸如TD(root=x) PBE1PBE/6-31G* density,最后给出的偶极矩就是第x激发态的偶极矩

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