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用Multiwfn做基于分子力场的能量分解结果分析求助

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发布时间: 2018-11-29 18:40

正文摘要:

之前有在论坛请教各位老师关于分子间弱相互作用分析的问题(http://bbs.keinsci.com/thread-11024-1-1.html),当时做了RDG图,因为没法定量分析,听取了老师们的意见,用了这个基于分子立场的能量分解分析(http:// ...

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lijiayisjtu 发表于 Post on 2019-1-8 11:06:49
用Multiwfn做基于分子力场的能量分解,这四个抠出来的片段还需要分别各自优化结构么?
万卷书万里路 发表于 Post on 2018-11-30 22:04:19
sobereva 发表于 2018-11-29 23:06
要分清楚环内的分子间的互斥,讨论环内的互斥没有意义。
对于环内互斥,越小的环,在环中央互斥肯定越大, ...

好的,谢谢老师!
我知道了讨论环内的互斥没有意义了,我是在分析这俩之间的pi-pi堆积作用时看到了排斥力的区别的。
我的目的是想知道,材料的结构是怎样影响了这个pi-pi作用(与电荷传输能力有关),做了这个能量分解分析以后发现其实dispersion反倒是ADT比并五苯大的,或者类似,但是由于这个ADT的repulsion更大,抵消了一部分dispersion,所以最后的总的dispersion是并五苯更强一点。
请问老师,这样理解对吗?
从结构上讲,该怎么解释呢?
谢谢!
sobereva 发表于 Post on 2018-11-29 23:06:35
要分清楚环内的分子间的互斥,讨论环内的互斥没有意义。
对于环内互斥,越小的环,在环中央互斥肯定越大,对应散点图里越靠右的spike
互斥作用可以按照原子对来分解分析,或者试图通过原子着色直观考察。

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