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蛋白-蛋白分子对接问题

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jackie

发布时间: 2018-12-4 19:38

正文摘要:

1.最近刚学会同源建模，由于要构建的蛋白质有3条氨基酸序列，使用modeller只能构建出每一条氨基酸序列的3D蛋白质结构，请问modeller可不可以将这三个序列一起同时预测出一个蛋白质结构？ 2.基于上一个问题，目前只 ...

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girlcrhong 发表于 Post on 2022-9-26 11:38:51

girlcrhong 发表于 2022-9-26 11:38
求http://bbs.keinsci.com/thread-7364-1-1.html 2016的版本，我级别太低，看不了

邮箱girlcrhong@163.com，非常感谢

girlcrhong 发表于 Post on 2022-9-26 11:38:11

Chenglong_li 发表于 2018-12-13 09:56
第一个问题：关于“蛋白质有3条氨基酸序列”，请问在PDB bank是否有一致性比较高的晶体结构？可以考虑将3条 ...

求http://bbs.keinsci.com/thread-7364-1-1.html 2016的版本，我级别太低，看不了

Chenglong_li 发表于 Post on 2018-12-13 09:56:05

第一个问题：关于“蛋白质有3条氨基酸序列”，请问在PDB bank是否有一致性比较高的晶体结构？可以考虑将3条序列放在一个序列窗口中并作为1条氨基酸序列，通过加入chain break，使程序来区分不同的链。
第二个问题：关于“要求输入server name（其实，我也不太清楚这是什么意思），于是将本地的IP地址输入进去，点击Test，出现一个error”，你现在所用的版本可能只是client端，本地或服务器上没有安装server端，建议下载并安装 http://bbs.keinsci.com/thread-7364-1-1.html 2016的版本，先安装DiscoveryStudio_Server_2016，然后再安装Discovery_Studio_Client_2016。

kunkun 发表于 Post on 2018-12-5 18:55:13

DS用的是ZDOCK.完全可以申请一个学术版，操作极为方便

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