sobereva 发表于 2019-1-16 23:26

Sob老师，如果一个polyatomic体系里有明显的分子内作用，是应该把原本有hbond的官能团距离调整到较远位置，做限制性优化之后再做scan呢？
还是用当前优化后有分子内氢键的结构做scan,同时获取分子内片段之间弱相互作用再扣除掉呢？

sobereva 发表于 2019-1-16 23:26

谢谢sob老师♪(･ω･)ﾉ，简单明了。我是真需要上一次老师您的课，我这基础太烂。

zhf0102 发表于 2019-1-16 16:34
sob老师，对于我计算的分子C-Ga之间的柔性扫描我做完了。还想请教一下sob老师，您说的在origin里建立Mors ...

sobereva 发表于 2019-1-14 11:58
在平衡位置附近柔性扫描C-Ga键长，在Origin里建立Morse势函数，然后拟合扫描的曲线即得到参数

注意看置 ...

sob老师，对于我计算的分子C-Ga之间的柔性扫描我做完了。还想请教一下sob老师，您说的在origin里建立Morse势函数，这一步怎么弄呢？  

sobereva 发表于 2019-1-16 05:13
拟合

sob老师您好，我对这个一点都不懂，您可以说的详细一些，我该怎么做吗？
先谢谢您了~~

zhf0102 发表于 2019-1-15 19:51
sob老师，还得麻烦您，我想算C-Ga之间的Morse potential，其中的D_e要怎么算呢？

拟合

sobereva 发表于 2019-1-15 11:46
当然可以算

sob老师，还得麻烦您，我想算C-Ga之间的Morse potential，其中的D_e要怎么算呢？

zhf0102 发表于 2019-1-15 08:27
谢谢sob老师，那对于我这个体系，归根结底还是算不了Morse potential了~

当然可以算

sobereva 发表于 2019-1-15 02:29
对于双原子分子而言是如此，但对于你当前的体系，拟合出来的D_e无法确切解释为BDE

谢谢sob老师，那对于我这个体系，归根结底还是算不了Morse potential了~

zhf0102 发表于 2019-1-14 20:39
sob老师，我刚才回复您太快。忘记了再继续问一个问题：
这里的D_e  { D_{e} is the well depth (defined ...

对于双原子分子而言是如此，但对于你当前的体系，拟合出来的D_e无法确切解释为BDE

sobereva 发表于 2019-1-14 11:58
在平衡位置附近柔性扫描C-Ga键长，在Origin里建立Morse势函数，然后拟合扫描的曲线即得到参数

注意看置 ...

sob老师，我刚才回复您太快。忘记了再继续问一个问题：
这里的D_e  { D_{e} is the well depth (defined relative to the dissociated atoms)}
我理解的D_e 就是原子的键解离能 (BDE)，我的理解，对吗？

sobereva 发表于 2019-1-14 11:58
在平衡位置附近柔性扫描C-Ga键长，在Origin里建立Morse势函数，然后拟合扫描的曲线即得到参数

注意看置 ...

谢谢sob老师，0.0
关于贴图，我一定会去看新人必读，不会再出现类似状况。

wbn 发表于 2019-1-14 11:06
在这个键接近平衡位置的地方（也就是可以近似为harmonic bond的地方）柔性扫描键长，然后用harmonic model  ...

谢谢你的回答，我先试一下~~

在平衡位置附近柔性扫描C-Ga键长，在Origin里建立Morse势函数，然后拟合扫描的曲线即得到参数

注意看置顶的新人必读关于正确贴图的方式，不要把QQ截图直接往窗口里粘，显然在别人的电脑上是不可能显示你的本机图片的