Hi,
Sorry I don't speak Chinese, so I'm writing here in english:

I'm trying to perform the ONIOM method for an enzymatic reaction: I've prepared all used TAO toolkit and Molup VMD tool (https://biosim.pt/molup/). All the parameters seems ok, the calculation begin but after few second give this kind of error:
"MMAtmC is confused about an atom type
Atom I=  4691 has type=        1000."

I don't know why Gaussian assign a strange code to the atom type of some of the carbon of my ligand
I'm attaching here the input and output I've obtained. https://easyupload.io/m/228w2z
Thank you

Emma_Zzz 发表于 2019-1-21 09:14
没有什么特殊原子啊，C,H,O,N,S。
Atom I=    27 has type=        1000.                              ...

你用parmchk2输出所有的AMBER参数看看
然后对照着http://bbs.keinsci.com/thread-942-1-1.html
看看有没有收获，不管怎么样，告诉我下结果哈

柒月小鱼 发表于 2019-1-18 09:59
我不太知道哈，我也是用好久的TAO感觉总是过不去
你这个有什么特殊的原子么，MMAtmC is confused about an ...

没有什么特殊原子啊，C,H,O,N,S。
Atom I=    27 has type=        1000.                                                         
MMAtmC is confused about an atom type.                                                   
根据这个报错信息，找到是氰基里面的碳原子有问题，但是不知道怎么改啊

我不太知道哈，我也是用好久的TAO感觉总是过不去
你这个有什么特殊的原子么，MMAtmC is confused about an atom type.  
我感觉TAO补的参数不一定完全合适，可以用AMBER自己对照着参数看看哈