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求助：editconf将pdb文件转为gro文件的问题

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naoki

发布时间: 2019-1-23 15:56

正文摘要:

本帖最后由 naoki 于 2019-1-23 16:05 编辑各位大神，我想请教一个问题。我用editconf将pdb文件转为gro文件（gmx editconf -f interface.pdb -o interface.gro），得到的gro文件最后一行盒子尺寸总显示0.00000&n ...

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zty 发表于 Post on 2020-2-20 19:28:02

naoki 发表于 2019-1-23 16:48
问题已解决，Sob老师在群里回答了：“ 你如果packmol的时候没设add_box_sides，本来pdb里就没有盒子信息，e ...

感谢分享，鄙视那些发帖求助后不回复抱有相同疑问后来者的楼主。

naoki 发表于 Post on 2019-1-23 16:48:49

问题已解决，Sob老师在群里回答了：“ 你如果packmol的时候没设add_box_sides，本来pdb里就没有盒子信息，editconf自然也不会瞎给你加盒子
手动改完全莫名其妙”。
输入add_box_sides 1.0就好了，再次感谢Sob老师~

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