一颗赛艇 发表于 2019-3-23 10:40
任何扫描都与成键无关

我觉得吧，如果按照你说的去做，设定好要扫描的两个分子中原子的距离时，Gaussian并不知道该往哪个方向移动啊，它极有可能沿着ab之间的方向去扫描，所以根本没办法完成我想要的绘制出势能面随着a，b两个方向的变化而变化的情况。

Novice 发表于 2019-3-23 08:58
不是，Gaussian扫描时好像默认沿键的方向吧，这现在两个分子间没有键。。。

任何扫描都与成键无关

一颗赛艇 发表于 2019-3-23 02:22
柔性扫描的话，我觉得你可以冻结一些角和二面角来保持平行，然后再扫描某个键长

刚性扫描的话直接扫对应 ...

不是，Gaussian扫描时好像默认沿键的方向吧，这现在两个分子间没有键。。。

柔性扫描的话，我觉得你可以冻结一些角和二面角来保持平行，然后再扫描某个键长

刚性扫描的话直接扫对应的两个碳原子就行了吧？

sobereva 发表于 2019-3-22 12:22
没有办法直接用Gaussian实现。你得自己写个程序，产生你期望的这种方式的二维扫描的各个点的结构然后批量运 ...

好的，多谢社长，我研究研究

没有办法直接用Gaussian实现。你得自己写个程序，产生你期望的这种方式的二维扫描的各个点的结构然后批量运行

诸如此文里的dimerscan就是我自己为了实现难以直接用Gaussian定义扫描方式而写的小程序，你也可以写个类似的
考察SAPT能量分解的能量项随分子二聚体间距变化的简单方法
http://sobereva.com/469（http://bbs.keinsci.com/thread-12324-1-1.html）