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gromacs中尝试在力场文件中添加成键项报错,请老师指点。

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发布时间: 2019-3-28 12:58

正文摘要:

老师们好,最近需要算一个络合物的分子,想用charmm36力场,但是有些参数ffbonded.itp里面没有,就在文件中添加了下面三段,然后出现了图片中的问题,麻烦老师看看哪里出了问题,还是说从分子拓扑文件开始就完全不对 ...

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Emma_Zzz 发表于 Post on 2019-11-25 15:25:36
Markmahao 发表于 2019-3-29 11:35
谢谢sob老师,根据你的指点我解决了大部分问题,现在发现charmm36力场中,不支持CG321和CG323的键连,不 ...

请教一下您,最后具体是怎么改的呢
Markmahao 发表于 Post on 2019-3-29 11:35:30
sobereva 发表于 2019-3-28 22:51
碰到报错的时候先着眼解决第一个,找到相应的行看怎么回事。字段顺序不能错

谢谢sob老师,根据你的指点我解决了大部分问题,现在发现charmm36力场中,不支持CG321和CG323的键连,不知道是不bug,总是提示No default bond types
sobereva 发表于 Post on 2019-3-28 22:51:10
碰到报错的时候先着眼解决第一个,找到相应的行看怎么回事。字段顺序不能错

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