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求助弱相互作用电子密度差的盆分析

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发布时间: 2019-3-28 21:13

正文摘要:

本帖最后由 ShuangfeiZhu 于 2019-3-28 21:13 编辑 想利用盆分析对电子密度差进行定量的分析,但是有些问题想不通,还请老师解答。使用的文件: Multiwfn程序examples/water_tetramer文件夹中的波函数文件。 具 ...

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sobereva 发表于 Post on 2019-3-29 09:29:37
ShuangfeiZhu 发表于 2019-3-29 08:48
老师,按照您说的,我上述模型做了域分析,但一直卡在Clustering domains这儿不动,是什么原因?电脑是铂 ...

你的用法不对。你应当先产生密度差格点数据,然后进入域分析功能,此时用选项3设置好标准,然后选-1直接用内存里的格点数据(密度差格点数据)来产生域
ShuangfeiZhu 发表于 Post on 2019-3-29 07:53:50
sobereva 发表于 2019-3-28 23:32
1 有。但是盆的图形和等值面的图形不同。你可以去挨个看各个盆的图形,会看到与你的等值面图的各个部分有对 ...

感谢老师的回复
sobereva 发表于 Post on 2019-3-28 23:32:20
1 有。但是盆的图形和等值面的图形不同。你可以去挨个看各个盆的图形,会看到与你的等值面图的各个部分有对应性,但形状截然不同。所有等值面的体积总和不等于盒子总大小(取决于等值面数值),而盆的空间总和对应盒子总大小。等值面图只是一种展现函数三维空间分布的一种便利的方式,而盆则是根据零通量面去把整个三维空间进行分解。

2 可取
顺带一提,如果你只是想积分等值面内部区域,Multiwfn也可以做到,这叫做域分析,可参考手册4.200.14节

3 这么说不完全严格。毕竟盆和原子并没有直接对应关系。如果你只是想考察原子上带的电子增减,直接考察原子电荷变化是最省事、明确的。

后面那是笔误,之后会修改

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