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使用AICD 2.0绘制磁感应电流图

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发布时间: 2015-6-13 08:27

正文摘要:

使用AICD 2.0绘制磁感应电流图Drawing magnetic induction current map using AICD 2.0 文/Sobereva @北京科音First release: 2015-Jun-13  Last update: 2024-Jan-26 以前写过一篇帖子《使用AICD程序研 ...

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sobereva 发表于 Post on 2024-8-4 07:28:09
wal 发表于 2024-8-2 11:24
这个可以用激发态自然轨道做分析吗

不能
wal 发表于 Post on 2024-8-2 11:24:33
这个可以用激发态自然轨道做分析吗
lycheeho 发表于 Post on 2023-8-31 13:15:57
QuantumicGuy 发表于 2023-8-30 14:42
RenderMich.pov文件里light_source应该可以调,rotate 也可以调分子展示的方向

非常感谢~
QuantumicGuy 发表于 Post on 2023-8-30 14:42:07
lycheeho 发表于 2023-8-30 14:22
你好,-m 4 后右上角会输出分子背面的AICD图,但是比较暗,请问有什么方法可以调亮呢?

RenderMich.pov文件里light_source应该可以调,rotate <a,b,c>也可以调分子展示的方向
lycheeho 发表于 Post on 2023-8-30 14:22:45
本帖最后由 lycheeho 于 2023-8-30 14:33 编辑
乐平 发表于 2022-3-25 14:56
谢谢。
第一次用,不知道这里是分辨率的意思。

你好,-m 4 后右上角会输出分子背面的AICD图,但是比较暗,请问有什么方法可以调亮呢?

202308301423156888..png (79.75 KB, 下载次数 Times of downloads: 77)

202308301423156888..png
kimariyb 发表于 Post on 2023-6-7 11:12:51
sobereva 发表于 2023-6-7 09:32
当然可以用于非平面体系,J. Phys. Chem. C 2019, 123, 18593−18599、Struct Chem (2014) 25:1521 ...

谢谢卢老师的回答,我阅读一下这篇文章。
sobereva 发表于 Post on 2023-6-7 09:32:49
kimariyb 发表于 2023-6-7 00:44
卢老师,想请教一下,如果是非平面体系的分子,可以使用AICD或GIMIC绘制磁感应电流图嘛。之前都是使用平面 ...

当然可以用于非平面体系,J. Phys. Chem. C 2019, 123, 18593−18599、Struct Chem (2014) 25:1521–1533(其中的SI)就是例子
kimariyb 发表于 Post on 2023-6-7 00:44:33
卢老师,想请教一下,如果是非平面体系的分子,可以使用AICD或GIMIC绘制磁感应电流图嘛。之前都是使用平面体系作为计算的例子,并没有试过非平面体系。但是今天有人给我发了一个非平面体系的分子,不知道该如何处理才好。
sobereva 发表于 Post on 2023-6-2 01:18:03
wzy 发表于 2023-6-1 16:36
考察NICS-sigma和NICS-pi时,得到pi轨道的磁屏蔽值,磁屏蔽值是看Isotropic吗?如果一次算多个pi轨道,输出 ...

看你计算什么,如果计算NICS_ZZ显然看的就不是isotropic
同时把多个pi轨道序号写进去不就完了
wzy 发表于 Post on 2023-6-1 16:36:27
本帖最后由 wzy 于 2023-6-1 16:39 编辑

考察NICS-sigma和NICS-pi时,得到pi轨道的磁屏蔽值,磁屏蔽值是看Isotropic吗?如果一次算多个pi轨道,输出文件中也只看到一个isotropic?怎么看到多个pi轨道的
sobereva 发表于 Post on 2022-6-7 08:12:48
wwwbobobo 发表于 2022-6-6 10:20
sob 老师,请教AICD相关问题:
“AICD有个毛病,就是输出的图像可能是当前分子的对应异构体!大家务必注意 ...

如果结构显示成了对应异构体,此时显示的环电流也是对映异构体的
wwwbobobo 发表于 Post on 2022-6-6 10:20:34
sob 老师,请教AICD相关问题:
“AICD有个毛病,就是输出的图像可能是当前分子的对应异构体!大家务必注意检查一下是否是这样,如果是的话,应自行在图像编辑软件里把图像左右翻转一下使之对应于原本的分子。”(http://sobereva.com/147
(1)判断手性分子的某个环芳香性,那么将图像左右镜像对称,虽然能使得分子结构正确,但是图上的电流方向也会改变,那么会不会导致芳香性分析的结果相反?
(2)假设AICD输出的刚好是对应的异构体,那么它此时的电流方向是依据 原始输入分子计算,还是依据这个异构体计算的?就是不知道这个输出结果哪部分是可信的?
sobereva 发表于 Post on 2022-4-22 01:28:58
乐平 发表于 2022-4-21 11:13
我申请到了目最新版的还 AICD 3.0.4,功能增强了很多,有你关心的调节电流方向箭头长度的功能。功能选项 ...

-maxarrow在最早的AICD版本里就已经有了,见《使用AICD程序研究电子离域性和磁感应电流密度》(http://sobereva.com/147
乐平 发表于 Post on 2022-4-21 14:02:18
乐平 发表于 2022-4-21 05:53
Sob 老师好,请教一下。我在 (AICD 的第一步)运行 Gaussian16 的时候报错:

Error termination via L ...

用 guess=read 可行,计算正常结束了

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