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求助multiwfn如何进行.grd文件的作差

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发布时间: 2019-4-26 11:20

正文摘要:

想用DMOL3计算差分电荷密度,之前看老师的帖子说可以在Multiwfn软件中使两个片段的电子密度作差来实现,但是Multiwfn可以导入grd文件,但是我输入的时候,显示只支持cub,不知道是怎么回事呢?刚接触这个软件,期待老 ...

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sobereva 发表于 Post on 2022-3-12 06:53:00
華華 发表于 2019-4-26 16:45
那如果是.grd的电子密度的文件作差的话可以用什么软件呢,看到有人说可以用Orign或者自己写小程序,但是由 ...

对于目前Multiwfn最新版,用Multiwfn载入grd文件,再用主功能13的子功能0导出cub文件,对每个grd文件都这么操作弄成cub文件
之后效仿Multiwfn手册4.13.2节的例子,对cub文件作差即可。下文也有对cub文件求差的例子
使用CP2K结合Multiwfn绘制密度差图、平面平均密度差曲线和电荷位移曲线
http://sobereva.com/638http://bbs.keinsci.com/thread-28225-1-1.html
sobereva 发表于 Post on 2022-3-12 06:51:24
天色将晚 发表于 2022-3-2 15:42
老师,我为什么从origin导出的数据用不了,analysis-total density 后会提示无法提取grd文件,以及Corrupt  ...

仔细看下文把问题交代清楚
在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚
http://sobereva.com/620http://bbs.keinsci.com/thread-25787-1-1.html
天色将晚 发表于 Post on 2022-3-2 15:42:35
老师,我为什么从origin导出的数据用不了,analysis-total density 后会提示无法提取grd文件,以及Corrupt data or unexpected end of file in grd file
華華 发表于 Post on 2019-4-28 12:50:32
sobereva 发表于 2019-4-27 01:26
实际上,让Multiwfn支持非正交格子很简单,但是即便支持了,也不支持输出grd文件。

用文本编辑器打开 ...

谢谢sob老师的解答了
sobereva 发表于 Post on 2019-4-27 01:26:27
華華 发表于 2019-4-26 16:45
那如果是.grd的电子密度的文件作差的话可以用什么软件呢,看到有人说可以用Orign或者自己写小程序,但是由 ...

实际上,让Multiwfn支持非正交格子很简单,但是即便支持了,也不支持输出grd文件。

用文本编辑器打开此文件,从第6列开始都是格点数据,复制出来,通过origin或excel对两个文件这部分求差,再粘贴回去即可
華華 发表于 Post on 2019-4-26 16:45:06
那如果是.grd的电子密度的文件作差的话可以用什么软件呢,看到有人说可以用Orign或者自己写小程序,但是由于刚接触这方面的知识,可以详细讲讲怎么操作吗?万分感激
華華 发表于 Post on 2019-4-26 15:53:55
sobereva 发表于 2019-4-26 12:35
cub文件和cubic格点完全是两码事
目前Multiwfn只支持矩形格点,换句话说,计算时候用的晶胞必须是矩形的。 ...

明白了,谢谢sob老师的解答
sobereva 发表于 Post on 2019-4-26 12:35:39
cub文件和cubic格点完全是两码事
目前Multiwfn只支持矩形格点,换句话说,计算时候用的晶胞必须是矩形的。以后也会支持非矩形格子

后记:如今的Multiwfn已经支持非正交格子

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