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优化碳纳米管160个碳原子,一直报错

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发布时间: 2019-5-2 14:24

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RES 发表于 Post on 2022-10-14 16:14:26
wzkchem5 发表于 2022-10-14 15:21
因为不加氢的开口碳管实验上很难做出来,算不加氢的开口碳管的实际意义不大。即使实验上能做出来(比如把 ...

多谢老师
wzkchem5 发表于 Post on 2022-10-14 15:21:44
RES 发表于 2022-10-14 07:43
请问老师,开口碳管为什么一定要加氢,我看过一篇文章做过不加氢的碳管的几何优化和振动分析,我打算重复 ...

因为不加氢的开口碳管实验上很难做出来,算不加氢的开口碳管的实际意义不大。即使实验上能做出来(比如把不开口的碳管掰断,或者用plasma打断),断口的结构也会重构,需要对断口做退火才能算,直接画个没饱和的zigzag或armchair边缘估计也不符合实际情况。
RES 发表于 Post on 2022-10-14 14:43:11
granvia 发表于 2019-5-2 14:42
不知道你的模型是两段加帽的碳管还是开口碳管?如是后者,必须用氢原子消除两端碳原子的悬键

请问老师,开口碳管为什么一定要加氢,我看过一篇文章做过不加氢的碳管的几何优化和振动分析,我打算重复他的工作。
shine 发表于 Post on 2019-5-3 12:58:28
sobereva 发表于 2019-5-2 16:07
仔细看
解决SCF不收敛问题的方法
http://sobereva.com/61

好的,非常感谢
ABetaCarw 发表于 Post on 2019-5-2 21:54:43
granvia 发表于 2019-5-2 20:03
有理有据。我错了

学术讨论,这局讨论没什么对错,作为旁观者,看到的是“理越辩越明”
granvia 发表于 Post on 2019-5-2 20:03:49
sobereva 发表于 2019-5-2 17:05
然而lz在提问时并没有体现出能量变化趋势(实际上从仅有的信息"Convg"的数值来看,即RMSDP,离默认的收敛 ...

有理有据。我错了
sobereva 发表于 Post on 2019-5-2 17:05:50
granvia 发表于 2019-5-2 16:34
得看具体情况。就lz这个问题,应看下SCF每步能量变化走向,如果能量一直降低有收敛趋势,可以提到SCF循环 ...

然而lz在提问时并没有体现出能量变化趋势(实际上从仅有的信息"Convg"的数值来看,即RMSDP,离默认的收敛限还有三个数量级),所以没有前提就鼓励使用解决SCF不收敛奏效几率最低的方法是不妥的。我的博文里也明确说了,只有看能量变化趋势,有收敛的苗头才适合增大迭代次数上限,所以我特意提及了不要“盲目”增大
仅当你观察迭代过程能量变化,发现随着迭代能量有缓慢降低,超过128步后继续迭代下去有希望收敛,才有必要加大循环次数上限,但极少会有这种情况出现。

关于几何结构不合理导致SCF难收敛这点的考虑,在我的博文里已经充分提及了
对于手动搭建的初始结构(往往结构偏离极小点较大),若使用某种想用的理论方法优化结构过程中出现SCF难收敛问题,除了使用有助于收敛的关键词、临时降低SCF标准外,也可以尝试先用其它对当前体系也基本合理的理论方法预优化(如使用半经验、用xtb程序做GFN-xTB),然后再改用实际要用的理论方法进一步优化,此时SCF不收敛的几率往往会减小很多。这方面更多的讨论看http://bbs.keinsci.com/thread-12578-1-1.html#pid86217

granvia 发表于 Post on 2019-5-2 16:34:38
sobereva 发表于 2019-5-2 16:07
仔细看
解决SCF不收敛问题的方法
http://sobereva.com/61

得看具体情况。就lz这个问题,应看下SCF每步能量变化走向,如果能量一直降低有收敛趋势,可以提到SCF循环次数。 另外,对于碳管这种经典成键体系,甚至可先用半经验方法取得较合理初猜几何构型,然后再用DFT优化。绝大多数SCF不收敛都是因初始几何构型不合理导致的
sobereva 发表于 Post on 2019-5-2 16:07:14
仔细看
解决SCF不收敛问题的方法
http://sobereva.com/61
绝对不要盲目增加SCF迭代次数,奏效几率极低,反倒还容易因此白浪费时间,博文里明确强调了。

用PBE算这种体系毫无好处,还容易招质疑。改用常用的B3LYP,还更容易SCF收敛。
几何优化别把SCF收敛限放宽。你这种体系只要结构没有什么硬伤,用B3LYP算,SCF收敛根本没有什么难的。

hakuna 发表于 Post on 2019-5-2 15:12:19
不怎么用G,这问题能用PBC玩儿么?
shine 发表于 Post on 2019-5-2 14:44:07
granvia 发表于 2019-5-2 14:42
不知道你的模型是两段加帽的碳管还是开口碳管?如是后者,必须用氢原子消除两端碳原子的悬键

是开口碳管,用两端的碳原子用氢原子连接的
granvia 发表于 Post on 2019-5-2 14:42:50
shine 发表于 2019-5-2 14:38
好的,我试一下,谢谢

不知道你的模型是两段加帽的碳管还是开口碳管?如是后者,必须用氢原子消除两端碳原子的悬键
shine 发表于 Post on 2019-5-2 14:38:29
granvia 发表于 2019-5-2 14:36
增大SCFCYC循环次数试试

好的,我试一下,谢谢
granvia 发表于 Post on 2019-5-2 14:36:41
增大SCFCYC循环次数试试

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