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求助-使用Multiwfn观看分子轨道的问题

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陈小北

发布时间: 2019-5-15 21:21

正文摘要:

本帖最后由陈小北于 2019-5-15 21:22 编辑 sob老师好我在您的这篇帖子（http://sobereva.com/449）中看到了Multiwfn观看分子轨道的操作流程，我已经操作成功了，只不过我有一个问题是我只想看图中红圈内的轨 ...

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sobereva 发表于 Post on 2019-5-21 01:56:11

陈小北发表于 2019-5-20 09:18
Sob老师好
我想问一下VMD有没有隐藏H原子的功能
因为感觉图片最后还是有点乱，所以想把H原子隐藏掉看一 ...

graphics - representation里的selected atoms框里输入noh

陈小北 发表于 Post on 2019-5-20 09:18:19

sobereva 发表于 2019-5-16 15:09
文中第3节开头就有

Sob老师好
我想问一下VMD有没有隐藏H原子的功能
因为感觉图片最后还是有点乱，所以想把H原子隐藏掉看一看
谢谢您

sobereva 发表于 Post on 2019-5-16 15:09:18

zjxitcc 发表于 2019-5-16 09:47
sob老师，Multiwfn显示轨道局部区域的功能虽然强大、方便、易用，但是万一碰到使用者缺乏理论基础，刻意 ...

文中第3节开头就有

有时候出于特殊目的，只想显示轨道中指定的原子所贡献的部分而屏蔽其它部分...

zjxitcc 发表于 Post on 2019-5-16 09:47:35

sobereva 发表于 2019-5-15 21:53
仔细看此文第3节，里面说了怎么只显示分子轨道的局部区域
使用Multiwfn观看分子轨道
http://sobereva.com ...

sob老师，Multiwfn显示轨道局部区域的功能虽然强大、方便、易用，但是万一碰到使用者缺乏理论基础，刻意只显示自己想要的区域，并发表之（没有强调"指定原子贡献"），那会造成歧义或误解的吧？建议您在博文里强调一下“指定原子贡献”和“特殊目的”。

陈小北 发表于 Post on 2019-5-16 08:13:24

sobereva 发表于 2019-5-15 21:53
仔细看此文第3节，里面说了怎么只显示分子轨道的局部区域
使用Multiwfn观看分子轨道
http://sobereva.com ...

好的我去学习，太感谢您了

陈小北 发表于 Post on 2019-5-16 08:12:34

zjxitcc 发表于 2019-5-15 21:31
没有隐藏这一说法，更不能这么做。这些看上去清楚的轨道，不过是把isovalue值适当调大一点。常见的0.02 ~ 0 ...

好的，知道了，谢谢您
祝您生活愉快~

sobereva 发表于 Post on 2019-5-15 21:53:22

仔细看此文第3节，里面说了怎么只显示分子轨道的局部区域
使用Multiwfn观看分子轨道
http://sobereva.com/269（http://bbs.keinsci.com/thread-462-1-1.html）

先在Multiwfn界面里手动操作一遍修改波函数信息的步骤，然后自行修改一下showorb.txt文件，把修改波函数信息对应的命令插到此文件开头即可

zjxitcc 发表于 Post on 2019-5-15 21:31:25

没有隐藏这一说法，更不能这么做。这些看上去清楚的轨道，不过是把isovalue值适当调大一点。常见的0.02 ~ 0.05都可以使用，在文章计算细节里讲明即可。大于0.05就有点投机取巧的嫌疑了。你画的轨道已经挺清楚了，适当调一下视角会更好。

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