granvia 发表于 2019-5-28 01:22 老师,我明白了,因为最后几个频率对应的是平动和转动自由度,所以对应的能量应该远小于振动能级,所以只要虚频在平动和转动自由度上,且其能量相较于振动能量占比很少即可忽略,上述理解不知道是否有问题,谢谢老师 |
granvia 发表于 2019-5-28 01:22 老师你好,那这么说是不是不对应振动的虚频无论多大都可以忽略? |
sobereva 发表于 2019-5-27 04:02 我的个人看法: 波数越大的振动越接近局域的谐振子,波数越小的振动谐振子的力常数越接近零,越接近自由平动。波数非常接近零的振动自由度,已经接近于理想自由平动模式了,用简谐近似不合理,但直接忽略也不合理。 如果振动模式是由H、N、O、F元素贡献的,且如果用隐式溶剂模型,比如水溶液,计算振动时并没有考虑振动模式与溶剂氢键网络的耦合。这些接近平动的模式实际上不应该存在,而是与氢键网络的振动耦合,(除非该元素与氢键网络没有相互作用),所以把小波数的振动手动改成水的振动波数可能更合理一些。当然这只是推测,没有严格证明。 |
老师您好,我目前遇到了消虚频问题。通过jmol软件查看,我的孤立体系计算也存在虚频。具体数据在我的最新论坛博文里。 我一开始想通过jmol可视化,将结构按照虚频旋转的方向保存进行重新优化。但是,我尝试保存失败了。 后续,我又尝试vaspkit的507程序,但是显示说“no imaginary-freq”。告诉我不存在虚频,与vaspkit论坛里,写的也不相同。 或许老师,有没有什么好的消虚频的方式? 我的体系中设置EDIFFG = -0.03,EDIFF = 1E-7,ENCUT = 500 |
sobereva 发表于 2023-6-27 23:28 好的 非常谢谢社长! |
nosugar 发表于 2023-6-27 20:49 得弄清楚造成的原因 诸如优化收敛已经足够精确,但由于CUTOFF太低等数值因素造成Hessian太糙而产生虚频,那不是结构自身的问题 再比如优化时对某些部分做了冻结而导致虚频,那也没法说是不稳定。 |
老师您好,想问一下我在计算一个氧气的吸附体系中,结构优化后计算频率,得到三个虚频都大于50cm-1,那这样的话是证明我的结构不稳定嘛?但是结构优化已经收敛,EDIFFG = -0.02,EDIFF = 1E-5。 |
飞翔的猪 发表于 2019-5-27 20:53 我最近用VASP计算过渡态,过渡态的虚频一直在十几或者二十几 i cm-1 , 如果按照小于50可以忽略的话,我这过渡态是不是就不存在?如果按照虚频不能随意忽略,我这过渡态就算是找到了。用了几种过渡态的方法和插不同的点,可以相互验证,基本就是这个过渡态结构了。不知道怎么判断了? |
nemolee 发表于 2022-8-11 22:20 可以 |
请问Gaussian中计算的小分子这种平动转动的虚频是可以忽略的吗?谢谢。 类似这种: Low frequencies --- -4.7750 -3.6574 -0.0018 0.0005 0.0017 2.7154 Low frequencies --- 23.8793 31.3131 42.5335 |
卡开发发 发表于 2020-1-8 22:43 收到,非常感谢! |
sige 发表于 2020-1-8 15:20 动能截断。 |
卡开发发 发表于 2019-5-27 20:52 请教卡老师,怎么增加FFT网格密度呢,增大K点吗 |
xxzj 发表于 2020-1-3 19:02 绝对不能 |
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