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计算EPR谱图用easyspin结合ORCA,打不开ORCA的输出文件求助

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发布时间: 2019-7-25 01:11

正文摘要:

老师您好,我看到之前的帖子您说计算EPR谱图用easyspin结合ORCA,我的orca2easyspin似乎打不开ORCA的输出文件,不知问题在哪,能否请您帮忙解答一下?

回复 Reply

奥利奥老东西 发表于 Post on 2026-1-30 08:23:50
Lakersruobai 发表于 2019-7-26 11:26
谢谢,已经解决了!

你好,请问一下是怎么解决的
wzkchem5 发表于 Post on 2023-5-6 15:44:48
nianbin 发表于 2023-5-5 14:18
好的,谢谢chem哥。话说这个计算好慢,matlaba跑了一个小时了快 还没出图

可以人为删掉那些极其小、肯定不会影响图谱的A值
QuantumicGuy 发表于 Post on 2023-5-6 12:03:07
nianbin 发表于 2023-5-6 11:29
请问是如何设置考虑几个电荷呀

是考虑计算的原子数,不是电荷,先看分子中哪些位置自旋密度大,然后选择自旋密度较大区域的磁性原子去用ORCA计算
nianbin 发表于 Post on 2023-5-6 11:29:11
QuantumicGuy 发表于 2023-5-6 09:15
不至于吧,是不是你算的原子数太多了,考虑四五个原子就行了(自旋密度大且是磁性核)

请问是如何设置考虑几个电荷呀
QuantumicGuy 发表于 Post on 2023-5-6 09:15:54
nianbin 发表于 2023-5-5 21:18
好的,谢谢chem哥。话说这个计算好慢,matlaba跑了一个小时了快 还没出图

不至于吧,是不是你算的原子数太多了,考虑四五个原子就行了(自旋密度大且是磁性核)
nianbin 发表于 Post on 2023-5-5 21:18:40
wzkchem5 发表于 2023-5-5 20:56
这个无所谓,可能因为orca输出文件的有效数字太少,导致本来应该正交的矩阵不是严格正交的。会对结果引入 ...

好的,谢谢chem哥。话说这个计算好慢,matlaba跑了一个小时了快 还没出图
wzkchem5 发表于 Post on 2023-5-5 20:56:05
nianbin 发表于 2023-5-5 12:54
请问各位老师,我orca2easyspin的时候出现如下 报错;是什么情况呀

这个无所谓,可能因为orca输出文件的有效数字太少,导致本来应该正交的矩阵不是严格正交的。会对结果引入一定误差,但是误差可以忽略
nianbin 发表于 Post on 2023-5-5 19:54:18
请问各位老师,我orca2easyspin的时候出现如下 报错;是什么情况呀

202305051953447020..png (25.7 KB, 下载次数 Times of downloads: 38)

202305051953447020..png
wzkchem5 发表于 Post on 2023-5-5 17:32:21
nianbin 发表于 2023-5-5 10:12
现在是这样子,请问该如何获得图谱呀

抱歉我看你回的是我说如何导出成csv的帖子,就理解错你的意思了。
easyspin的在线手册里写了应该怎么做,我手头没有链接,你搜一下easyspin就找到了
nianbin 发表于 Post on 2023-5-5 17:12:25
现在是这样子,请问该如何获得图谱呀

202305051712093843..png (41.85 KB, 下载次数 Times of downloads: 54)

202305051712093843..png
nianbin 发表于 Post on 2023-5-5 17:11:42
wzkchem5 发表于 2023-5-5 17:00
这种问题不用问人,自己搜一下怎么把csv文件导入origin就知道了。
有的进阶一点的问题,可能只有谷歌才 ...

不是 我的意思是我easyspin现在可以正确读取orca的数据了,但是不能显示图谱,我应该如何拟合得到图谱
wzkchem5 发表于 Post on 2023-5-5 17:00:13
nianbin 发表于 2023-5-5 09:39
chem哥,请问我正确读取数据了,如何获得图谱呀

这种问题不用问人,自己搜一下怎么把csv文件导入origin就知道了。
有的进阶一点的问题,可能只有谷歌才能搜出合理的答案,那还可以以用不了谷歌为由问人;但是这种问题显然是即使百度都可以搜出靠谱答案的
nianbin 发表于 Post on 2023-5-5 16:39:50
wzkchem5 发表于 2020-12-10 10:33
dlmwrite('xxx.csv',');
导出成csv格式,可以用origin读取。

chem哥,请问我正确读取数据了,如何获得图谱呀
nianbin 发表于 Post on 2023-5-5 16:35:30
那丢失的 发表于 2020-12-10 10:07
你好,我得到图了,但是不知道如何保存为数据点表,这样就没办法用origin作图了

请问下我正确读取数据了  如何获得图谱呀

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