求助：MS2017对CaCO3切面前后不一致

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发布时间: 2019-7-25 17:52

本帖最后由 tjuptz 于 2020-2-3 15:39 编辑本人4月份用MS2017对CaCO3的cif文件进行切面建模，获得的模型虽然键连有点问题，但经过处理或者将connect字段删除就可以获得Ca2+和CO32-数目相等且阴离子完好的模型， ...

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tjuptz 发表于 Post on 2019-7-26 10:41:53

已解决。通过MS自带的calcite.msi文件创建模型过程对比发现，使用的cif文件不自带连接关系，通过calculate bonds工具添加键连关系后再进行创建即可重复出之前的操作了。

tjuptz 发表于 Post on 2019-7-25 22:07:21

又发现有问题的pdb文件里的connect字段缺失……

tjuptz 发表于 Post on 2019-7-25 18:12:46

hakuna 发表于 2019-7-25 17:58
切面时平移一下就行了

平移或可解决上下表面的问题，但左右边界好像还是不行吧？另外，请问您是否知道这是什么原因造成的呢

hakuna 发表于 Post on 2019-7-25 17:58:19

切面时平移一下就行了

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