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求助:Gromacs安装cmake一直报错找不到文件

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发布时间: 2019-8-21 23:36

正文摘要:

本帖最后由 a617788816 于 2019-8-26 16:40 编辑 我是Gromacs初学者,在安装Gromacs的时候cmake一直报错,源目录找不到文件,不知道如何解决,已经先安装了fftw3.3.8,gromacs是2019.3的版本,请各位大神帮忙解答 ...

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sobereva 发表于 Post on 2019-8-27 00:42:52
装OpenMPI干嘛,难道要跨节点?
连安装视频都录了,没法说得更清楚了
a617788816 发表于 Post on 2019-8-26 16:42:35

sob老师,我在安装Gromacs的过程中没有报错,用的是MPI和AVI_256,也填写了source,但是最后出来看GMX版本却显示没这个命令,这是怎么回事?装没装进去?情况如上图
a617788816 发表于 Post on 2019-8-23 21:20:19
本帖最后由 a617788816 于 2019-8-24 18:26 编辑

sob老师,在安装CUDA toolkit的过程中出现报错,安装过程完全按照官网上的指令,图片如上,不知道是不是我选的下载类型有问题,帖子中未提到下载哪个,所以我自己选择了rpm network,sob老师您帮忙看看是什么原因报错
sobereva 发表于 Post on 2019-8-23 14:55:04
a617788816 发表于 2019-8-23 10:28
sob老师,安装cmake在自己的指定路径的代码要怎么打啊?能指导一下吗

GROMACS的安装方法(含全程视频演示)
http://sobereva.com/457http://bbs.keinsci.com/thread-11821-1-1.html

此文第1节里已增加cmake编译和指定安装路径的方法
a617788816 发表于 Post on 2019-8-23 10:28:06
sobereva 发表于 2019-8-22 11:45
找管理员要个root密码装公共目录下,要么编译cmake在make install前指定成安装在自己的私有路径下

sob老师,安装cmake在自己的指定路径的代码要怎么打啊?能指导一下吗
a617788816 发表于 Post on 2019-8-22 13:10:32
本帖最后由 a617788816 于 2019-8-22 17:25 编辑
sobereva 发表于 2019-8-22 11:45
找管理员要个root密码装公共目录下,要么编译cmake在make install前指定成安装在自己的私有路径下

请问这个代码要怎么打呢?在make install前面要怎么加?
sobereva 发表于 Post on 2019-8-22 11:45:14
a617788816 发表于 2019-8-22 10:14
我按照您之前的帖子 http://bbs.keinsci.com/thread-43-1-1.html
安装cmake,因为我的版本查看了是2.8的 ...

找管理员要个root密码装公共目录下,要么编译cmake在make install前指定成安装在自己的私有路径下
a617788816 发表于 Post on 2019-8-22 10:14:28
本帖最后由 a617788816 于 2019-8-22 10:19 编辑
sobereva 发表于 2019-8-22 00:17
严格照着这个装,文中的命令有空格的地方不能省,看清楚空格
GROMACS的安装方法(含全程视频演示)
http: ...

我按照您之前的帖子 http://bbs.keinsci.com/thread-43-1-1.html
安装cmake,因为我的版本查看了是2.8的,但是显示安装没成功,不知道是什么问题, 因为我是user用户安装,就用了您之前的方法
图片我添加了,请sob老师帮我看一下
少年爱吃地三鲜 发表于 Post on 2019-8-22 08:03:39
你可以 whereis cmake 先找一下 系统里有没有cmake  有的话 再加到环境变量里就行了。
sobereva 发表于 Post on 2019-8-22 00:17:33
严格照着这个装,文中的命令有空格的地方不能省,看清楚空格
GROMACS的安装方法(含全程视频演示)
http://sobereva.com/457http://bbs.keinsci.com/thread-11821-1-1.html

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