求助：请问我能量最小化时出现这样的错误是怎么回事，可以怎么修改进行呢？

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发布时间: 2019-9-9 15:19

本帖最后由西南向北于 2019-9-9 15:54 编辑求助求助：gromacs新手，我将我的矿物体系grompp 以后，然后进行能量最小化；使用的.mdp文件如下 ; energy minimization define &nbs ...

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Reallihua 发表于 Post on 2021-3-10 08:35:48

您好，请问您解决了这个问题了嘛。我也遇到了类似的问题

sobereva 发表于 Post on 2019-9-10 06:31:49

绝对不要用all-bonds，本论坛里我说过多遍。去了再试
仔细检查结构和拓扑文件判断是否有不合理性，如果死活看不出来问题，用双精度版gmx做em再试

西南向北 发表于 Post on 2019-9-9 15:25:15

我也进行过更改 emstep nsteps 但是之后仍会出现这样的情况

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