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NBO5计算电子自旋布局为负值

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发布时间: 2019-9-13 09:03

正文摘要:

大家好,最近在用NBO5计算一个complex 弱相互作用的体系时,计算的自然电子密度产生负值(最后一列),请问是什么原因造成的呢?用Multiwfn+VMD作图后,取0.01等值面,如图2。

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sobereva 发表于 Post on 2025-2-7 04:44:06
ljh123 发表于 2025-2-6 20:01
sob老师,因为这个过程我是在显式水模型下用AIMD得到的,由于该反应涉及水溶剂的质子转移过程,因此常规D ...

对于片段已经充分分离的轨迹部分,倘若相邻的帧出现了1和-1的突变, 正说明本质上此时1和-1的能量是简并的,没必要区分
ljh123 发表于 Post on 2025-2-6 20:01:19
sobereva 发表于 2025-2-6 17:45
都已经均裂了,意味着没有相互作用了,毫无理由再一起算

sob老师,因为这个过程我是在显式水模型下用AIMD得到的,由于该反应涉及水溶剂的质子转移过程,因此常规DFT考虑隐式溶剂模型的情况下我找不到过渡态以及产物。因此我得到的产物也是一起存在于显式水分子中的。所以可能不太适合分开算。
我对该过程的各个帧计算了自旋布局,发现键均裂后,有些帧的有机物自旋布居接近1,有些帧则接近-1。该过程的总自旋多重度一直为5。这就导致我不太清楚我在计算产物时,因该用自旋布居接近1的帧还是-1的帧
sobereva 发表于 Post on 2025-2-6 17:45:11
ljh123 发表于 2025-2-6 14:57
感谢sob老师解答。但是如果我想把产物放在一起算的话,我设置自旋多重度应该是5(对应有机自由基自旋布居 ...

都已经均裂了,意味着没有相互作用了,毫无理由再一起算
ljh123 发表于 Post on 2025-2-6 14:57:52
sobereva 发表于 2025-2-4 14:48
1还是-1都一样,本来片段就是单独计算的,1和-1能量都是相同的

感谢sob老师解答。但是如果我想把产物放在一起算的话,我设置自旋多重度应该是5(对应有机自由基自旋布居为-1,金属离子自旋布居为5)还是7呢(对应有机自由基自旋布居为+1,金属离子自旋布居为5)。
sobereva 发表于 Post on 2025-2-4 14:48:39
ljh123 发表于 2025-2-3 22:45
sob老师我表达的有问题十分不好意思,我的意思就是配位键均裂前和均裂后体系的总自旋多重都都是5。反应物 ...

1还是-1都一样,本来片段就是单独计算的,1和-1能量都是相同的
ljh123 发表于 Post on 2025-2-3 22:45:54
sobereva 发表于 2025-2-3 04:34
“均为5”不知道你指什么
自旋多重度只能为>=1的整数
拿不准基态自旋多重度是什么就对比不同自旋态的能 ...

sob老师我表达的有问题十分不好意思,我的意思就是配位键均裂前和均裂后体系的总自旋多重都都是5。反应物状态时,金属离子和有机物形成配位键,金属离子有4个未成对电子,有机物没有未成对电子。此时配位键发生均裂后,若有机物带有一个未成对电子,也就是失一个电子形成自由基时,该有机自由基总的自旋布居应该是1还是-1呢?
sobereva 发表于 Post on 2025-2-3 04:34:00
ljh123 发表于 2025-2-3 02:44
sob老师,我想请问下一种情况:金属离子和有机物的配位键发生均裂,形成有机自由基和低价态金属离子,自 ...

“均为5”不知道你指什么
自旋多重度只能为>=1的整数
拿不准基态自旋多重度是什么就对比不同自旋态的能量
ljh123 发表于 Post on 2025-2-3 02:44:27
sobereva 发表于 2019-9-13 12:50
自旋布居有负值太正常了,什么含义一看定义便知。仔细看此文
谈谈自旋密度、自旋布居以及在Multiwfn中的绘 ...

sob老师,我想请问下一种情况:金属离子和有机物的配位键发生均裂,形成有机自由基和低价态金属离子,自旋多重度均为5。那此时这个有机自由基的自旋多重度应该是-1还是1呢。
xiaobogaga 发表于 Post on 2019-9-13 13:45:43
sobereva 发表于 2019-9-13 12:50
自旋布居有负值太正常了,什么含义一看定义便知。仔细看此文
谈谈自旋密度、自旋布居以及在Multiwfn中的绘 ...

谢谢sob老师
sobereva 发表于 Post on 2019-9-13 12:50:46
自旋布居有负值太正常了,什么含义一看定义便知。仔细看此文
谈谈自旋密度、自旋布居以及在Multiwfn中的绘制和计算
http://sobereva.com/353http://bbs.keinsci.com/thread-4422-1-1.html
granvia 发表于 Post on 2019-9-13 11:19:20
自旋密度为-1表示有个beta单电子嘛

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