计算化学公社»论坛首页 › 理论与计算化学 (Theoretical and Computational Chemistry) › 分子模拟 (Molecular Modeling) › 研究不同压力和温度时分子动力学的初始模型选择的问题

研究不同压力和温度时分子动力学的初始模型选择的问题

查看数: 8403 | 评论数: 5 | 收藏 Add to favorites 0

关灯 | 提示：支持键盘翻页<-左右->

帖子模式

huangyoyo

发布时间: 2019-9-27 15:39

正文摘要:

想研究某个物质50-300GPa，300K-600K之间的结构变化以及相关的一些性质，那么我们初始结构可以选择别人做MD的结果么？目前有人用MD研究从3GPa-60Gpa,100K-300K的结构变化，我可以直接拿他50GPa，300K的结构作为我的 ...

回复 Reply

yygong 发表于 Post on 2022-8-6 14:26:18

请问，能发下相关论文连接吗？这个MD是Gromacs计算的？

sobereva 发表于 Post on 2020-3-22 15:30:37

huangyoyo 发表于 2020-3-19 22:58
如果这个初始结构是压力为5GPa的结构，我想通过分子动力学得到他600GPa的结构，设置多大的压力间隔较为合 ...

先直接跑600GPa，看看结果，之后觉得有必要的话再在之间插一些点

huangyoyo 发表于 Post on 2020-3-19 22:58:22

sobereva 发表于 2019-9-28 02:57
如果你用的力场、各种计算细节设定都和原文里一样或非常接近，用文章里直接给的结构当初始结构即可

如置 ...

如果这个初始结构是压力为5GPa的结构，我想通过分子动力学得到他600GPa的结构，设置多大的压力间隔较为合适？或者可以直接把压力设置到600GPa，延长模拟的时间？我之前一直是压力间隔设置为50，跑一次需要一个星期，跑到600GPa差不多需要两个月。

sobereva 发表于 Post on 2019-9-28 02:57:25

如果你用的力场、各种计算细节设定都和原文里一样或非常接近，用文章里直接给的结构当初始结构即可

如置顶的新社员必读贴和论坛首页的公告栏所示，求助帖必须在帖子标题明确体现出“提问”、“求助”要素及具体内容（仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html），我已把你的标题“分子动力学的初始模型选择”改了，以后务必注意

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register