Chess1357 发表于 2025-12-27 16:37 原理上对于任意分子都可以。但是巨大的生物分子体系基于波函数算静电势算不动，只能基于原子电荷算，如下文 基于原子电荷极快速绘制超大体系的分子表面静电势图 http://sobereva.com/639（http://bbs.keinsci.com/thread-28913-1-1.html） |
Chess1357 发表于 2025-12-27 16:36 Multiwfn主功能12对静电势分析完后，后处理菜单选择导出表面顶点成为vtx.pqr，放到VMD里显示，选择语句按照charge属性（当前对应于静电势）设置。诸如选择语句用charge < -0.03 代表只显示表面静电势值< -0.03 a.u.的表面顶点部分。 |
Chess1357 发表于 2025-12-27 16:36 另外生物大分子比如核酸蛋白质，也可以参照文中的方法进行MPI计算吗？期待指点，谢谢！！！ |
| 真是一篇非常出色的介绍！现在我想知道运用MPI方法衡量分子极性时，能否将极性表面和非极性表面进行可视化呢按照文中的定义？谢谢sob老师！！！！ |
sobereva 发表于 2025-11-17 20:12 啊我想明白了，谢谢老师指点  |
sgwzq 发表于 2025-11-17 16:26 最低阶非零多极矩没有原点依赖性 甲烷最低阶非零多极矩是四极矩，所以不依赖于原点。而偶极矩不为0的分子的四极矩就有原点依赖性 |
| sob老师您好，我有一个问题：电四极矩的定义是电荷量，乘以直角坐标平方，再求和，如果坐标选取不同，电四极矩的值应该不一样吧？如果建模的时候把甲烷质心放在(0.0,0.0,0.0)，和把它放在(1.0, 0.0, 0.0)，Gaussian应该会给出不一样的值吧？这样比较是不是就没有意义了？ |
EmperorXiang 发表于 2024-3-9 21:05 不是导出，而是需要额外计算 后HF波函数不是后HF能量的直接的副产物，就如同你计算能量也不会免费得到能量的导数 |
sobereva 发表于 2024-3-9 05:44 不过为什么post-HF波函数的导出会花费那么长的时间呢？ |
sobereva 发表于 2024-3-9 05:44 明白了，感谢社长 |
wzkchem5 发表于 2024-3-9 00:14 但测试时用CCSD和CCSD(T)单点算出来的偶极矩和HF是一样的。是我的设置出了问题吗？比如我用CCSD(T)/aug-cc-pVQZ//CCSD/cc-pVTZ计算得到的水分子的偶极矩是1.99D，而HF/aug-cc-pVQZ//CCSD/cc-pVTZ得到的也是这个值。 |
EmperorXiang 发表于 2024-3-8 16:39 足够高阶的post-HF方法不会高估偶极矩，比如CCSD(T)一般问题不大 |
sobereva 发表于 2024-3-8 05:10 确实有注意到这一点，似乎连带一众post-HF都高估偶极矩。那应该使用什么方法？ |
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