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castep结构优化后出现原子消失

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发布时间: 2019-10-20 12:48

正文摘要:

各位老师好,我在用MS castep模块进行结构优化然后能量计算时发现一个很奇怪的现象,结构优化时结构还是正常的,如图一,但把结构优化后的结构再投入能量计算时发现有部分原子消失了(如图2),或者将display style ...

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安好 发表于 Post on 2023-7-10 17:08:45
寻找Medusa 发表于 2021-10-15 13:23
卡卡老师,做吸附的时候出现这种情况还能再继续进行计算吗

您好,同样想问一下做吸附的时候出现这种情况还能继续进行计算吗?
CCC显瘦 发表于 Post on 2023-5-29 15:31:58
您好楼主想问一下您解决了小时的问题了吗
UPC-Ning 发表于 Post on 2023-3-27 20:53:43
PESPES 发表于 2021-6-8 20:34
有没有能显示的方法啊?

请问您知道如何全部显示了吗
寻找Medusa 发表于 Post on 2021-10-15 15:16:11
卡开发发 发表于 2021-10-15 15:13
无关,可能是display style的问题。

好哒,谢谢卡卡老师了,太感谢了
卡开发发 发表于 Post on 2021-10-15 15:13:17
寻找Medusa 发表于 2021-10-15 15:04
好哒,太感谢卡卡老师了,我还有个疑问,这会不会和在进行表面吸附计算结构优化时没选optimize cell有关 ...

无关,可能是display style的问题。
寻找Medusa 发表于 Post on 2021-10-15 15:04:50
卡开发发 发表于 2021-10-15 14:46
可以继续算,实在不行你确定一下.castep文件下面的坐标部分原子数目和类型对不对。

好哒,太感谢卡卡老师了,我还有个疑问,这会不会和在进行表面吸附计算结构优化时没选optimize cell有关呢?
卡开发发 发表于 Post on 2021-10-15 14:46:56
寻找Medusa 发表于 2021-10-15 13:23
卡卡老师,做吸附的时候出现这种情况还能再继续进行计算吗

可以继续算,实在不行你确定一下.castep文件下面的坐标部分原子数目和类型对不对。
寻找Medusa 发表于 Post on 2021-10-15 13:23:22
本帖最后由 寻找Medusa 于 2021-10-15 13:40 编辑
卡开发发 发表于 2019-10-21 12:22
消失正常啊,边界上重复的原子就不显示了啊。

卡卡老师,做吸附的时候出现这种情况还能再继续进行计算吗
PESPES 发表于 Post on 2021-6-8 20:34:32
有没有能显示的方法啊?
战泽天 发表于 Post on 2019-10-26 20:07:06
卡开发发 发表于 2019-10-26 16:09
可以这么做,但效果怎样我不好说。

好的
卡开发发 发表于 Post on 2019-10-26 16:09:30
战泽天 发表于 2019-10-26 14:27
想要把cut-off energy提高一些,从400eV调到500eV,然后把SCF tolerance 降低,从1.0e-6调到5.0e-6,调整 ...

可以这么做,但效果怎样我不好说。
战泽天 发表于 Post on 2019-10-26 14:27:30
卡开发发 发表于 2019-10-26 14:08
看调整哪些参数,有些可以节省,有些反而不行。

想要把cut-off energy提高一些,从400eV调到500eV,然后把SCF tolerance 降低,从1.0e-6调到5.0e-6,调整这两个参数的话可以节省时间吗?
卡开发发 发表于 Post on 2019-10-26 14:08:41
战泽天 发表于 2019-10-26 11:35
明白了。再请教您一个关于结构优化的问题,我在fine的精度下进行结构优化,虽然并没有收敛,但得到一个相 ...

看调整哪些参数,有些可以节省,有些反而不行。
战泽天 发表于 Post on 2019-10-26 11:35:19
卡开发发 发表于 2019-10-26 11:22
尽量避免扩散的粒子间有相互作用即可。

明白了。再请教您一个关于结构优化的问题,我在fine的精度下进行结构优化,虽然并没有收敛,但得到一个相对优化的结构,我用这个结构调整参数重新优化,跟用之前完全没有优化的结构相比,可以节省优化时间吗?

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